RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 FBF1Q8TES7 1133 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ATL1Q8WXF7 558 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 EXT2Q93063 718 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 NXNL1Q96CM4 212 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 GPR22Q99680 433 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 RBBP8Q99708 897 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 PELI2Q9HAT8 420 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 KCNK13Q9HB14 408 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 POLEQ07864 2286 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 HIVEP1P15822 2718 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 POLQO75417 2590 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 AKAP9Q99996 3911 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 FHP07954 510 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 MAOAP21397 527 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 AHRP35869 848 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 GP5P40197 560 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC26A5P58743 744 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 CDKL1Q00532 357 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 POU4F1Q01851 419 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 CALCOCO2Q13137 446 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 TUBA3CQ13748 450 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 BMPR2Q13873 1038 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 DOC2AQ14183 400 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 HERC3Q15034 1050 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ACER2Q5QJU3 275 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 LCE1DQ5T752 114 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ISCA2Q86U28 154 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 GPSM1Q86YR5 675 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 BBOF1Q8ND07 529 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 M1APQ8TC57 530 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ELP5Q8TE02 316 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 DOK4Q8TEW6 326 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 CCT6BQ92526 530 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ANKRD7Q92527 254 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 UCN3Q969E3 161 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 VPS50Q96JG6 964 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 QRFPRQ96P65 431 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 F2RL3Q96RI0 385 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 CPNE1Q99829 537 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 DERL2Q9GZP9 239 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 KLHL1Q9NR64 748 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 DYTNA2CJ06 578 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 LRIT2A6NDA9 550 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 OR5H15A6NDH6 313 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 UBXN8O00124 270 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 PCDH17O14917 1159 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 PRMT3O60678 531 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 PRAMEF2O60811 474 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ZG16O60844 167 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 UQCRHP07919 91 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 SERPINA6P08185 405 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ICAM2P13598 275 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 EDN3P14138 238 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 STMN1P16949 149 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 GGT5P36269 586 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 PLA2G16P53816 162 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC12A2P55011 1212 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 RGS1Q08116 209 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF766Q5HY98 468 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 GRTP1Q5TC63 336 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF4B-208ENST00000490653 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms