RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 GDE1Q9NZC3 331 aa12.84□□□□□ -0.35
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HDLBP-241ENST00000487169 UQCRC2P22695 453 aa12.83□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 MAP3K8P41279 467 aa12.83□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 GRIK2Q13002 908 aa12.83□□□□□ -0.36
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HDLBP-241ENST00000487169 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
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HDLBP-241ENST00000487169 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
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HDLBP-241ENST00000487169 FAM189A1O60320 539 aa12.83□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 ATP6V1G1O75348 118 aa12.83□□□□□ -0.36
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HDLBP-241ENST00000487169 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 SHANK3Q9BYB0 1731 aa12.83□□□□□ -0.36
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HDLBP-241ENST00000487169 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.83□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 TIAM2Q8IVF5 1701 aa12.83□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 HCRTR2O43614 444 aa12.83□□□□□ -0.36
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HDLBP-241ENST00000487169 KDELC1Q6UW63 502 aa12.83□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 CARM1Q86X55 608 aa12.83□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa12.83□□□□□ -0.36
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HDLBP-241ENST00000487169 C1orf216Q8TAB5 229 aa12.83□□□□□ -0.36
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HDLBP-241ENST00000487169 AP3S2P59780 193 aa12.82□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 CCINQ13939 588 aa12.82□□□□□ -0.36
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HDLBP-241ENST00000487169 ANKLE1Q8NAG6 615 aa12.82□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 TOR3AQ9H497 397 aa12.82□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 UBAP1Q9NZ09 502 aa12.82□□□□□ -0.36
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HDLBP-241ENST00000487169 HEXBP07686 556 aa12.82□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 SLC9A3P48764 834 aa12.82□□□□□ -0.36
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HDLBP-241ENST00000487169 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa12.82□□□□□ -0.36
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HDLBP-241ENST00000487169 OR4N5Q8IXE1 308 aa12.82□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 IL22RA1Q8N6P7 574 aa12.82□□□□□ -0.36
HDLBP-241ENST00000487169 KDM1BQ8NB78 822 aa12.82□□□□□ -0.36
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