RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 NAT2P11245 290 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 MYL12AP19105 171 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 PRIM2P49643 509 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 STK19P49842 368 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC32Q14392 662 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ZSWIM7Q19AV6 140 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 TSPAN33Q86UF1 283 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 MED28Q9H204 178 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 DIABLOQ9NR28 239 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 CD84Q9UIB8 345 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ING4Q9UNL4 249 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ERVW-1Q9UQF0 538 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0B4J293 547 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 CR2P20023 1033 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF81P51508 661 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.088e-7■■■■□ 24.4
CCSAP-204ENST00000483092 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL12Q53G59 568 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 PAQR6Q6TCH4 344 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SLC51BQ86UW2 128 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 OR4M1Q8NGD0 313 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 RNF31Q96EP0 1072 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 QRFPRQ96P65 431 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 FAM227AF5H4B4 570 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 MTX2O75431 263 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SDC2P34741 201 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SPHARQ15513 63 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 BHLHB9Q6PI77 547 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 CRELD1Q96HD1 420 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB118Q96PH6 123 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 RIMKLBQ9ULI2 386 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 GSAPA4D1B5 854 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 J3KTA2 159 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ORC5O43913 435 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 CNR2P34972 360 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 RAB8AP61006 207 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 NELL1Q92832 810 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM169Q96HH4 297 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 KCNH6Q9H252 994 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 MAPRE3Q9UPY8 281 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 GSTM1P09488 218 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 GLULP15104 373 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ACPPP15309 386 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 M6PRP20645 277 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SOX9P48436 509 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 CLCN7P51798 805 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf80Q0P641 193 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SNTA1Q13424 505 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF367Q7RTV3 350 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 LUZP2Q86TE4 346 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SYT14Q8NB59 555 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 FBLIM1Q8WUP2 373 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 V9GYH0 126 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35F4A4IF30 521 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 WNT9AO14904 365 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMDEC1O15204 470 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 INPPL1O15357 1258 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ETV3P41162 512 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 RGS4P49798 205 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 HTRA3P83110 453 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 GALEQ14376 348 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 OTULINQ96BN8 352 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ASIC4Q96FT7 647 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 MYO19Q96H55 970 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRA2Q9H9E1 313 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 KLK4Q9Y5K2 254 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 PATJQ8NI35 1801 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SUOXP51687 545 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SSX1Q16384 188 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 RNF130Q86XS8 419 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 FZD4Q9ULV1 537 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 HOXD10P28358 340 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 PSPHP78330 225 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 HSPA14Q0VDF9 509 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 BCL2L15Q5TBC7 163 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms