RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 S100A3P33764 101 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 HPCAL1P37235 193 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MAGEA8P43361 318 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 HSD11B2P80365 405 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 HMGCS1Q01581 520 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 FAM53BQ14153 422 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TCEA2Q15560 299 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CPTPQ5TA50 214 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 GPR180Q86V85 440 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 NUDT13Q86X67 352 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 OR2T11Q8NH01 316 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 OR8K5Q8NH50 307 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 IFI44Q8TCB0 444 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SPDL1Q96EA4 605 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 APIPQ96GX9 242 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ITCHQ96J02 903 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 OR2A5Q96R48 311 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 WDR41Q9HAD4 459 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 EHD3Q9NZN3 535 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CROTQ9UKG9 612 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SATB2Q9UPW6 733 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 RP1P56715 2156 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CPED1A4D0V7 1026 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 AIM2O14862 343 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 GMNNO75496 209 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 KCNH1O95259 989 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 BMP10O95393 424 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CPNE6O95741 557 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 NTRK1P04629 796 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PGRP06401 933 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 HBQ1P09105 142 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SFTPCP11686 197 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PPP2R1BP30154 601 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PGM1P36871 562 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 KIR3DL1P43629 444 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 HTR6P50406 440 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MAPK12P53778 367 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ARSFP54793 590 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 DIO3P55073 304 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MTTPP55157 894 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CORO7P57737 925 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ACY1Q03154 408 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 NFATC3Q12968 1075 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 RCAN2Q14206 197 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 GRM7Q14831 915 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 IRGCQ6NXR0 463 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PAOXQ6QHF9 649 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 RNF44Q7L0R7 432 aa6.67□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ASRGL1Q7L266 308 aa6.67□□□□□ -1.34
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