RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 SOX9P48436 509 aa7.36□□□□□ -1.23
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USP54-210ENST00000466048 UGT3A2Q3SY77 523 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.36□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ABHD13Q7L211 337 aa7.36□□□□□ -1.23
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USP54-210ENST00000466048 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.36□□□□□ -1.23
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USP54-210ENST00000466048 OR2T12Q8NG77 320 aa7.36□□□□□ -1.23
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USP54-210ENST00000466048 SMIM14Q96QK8 99 aa7.36□□□□□ -1.23
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USP54-210ENST00000466048 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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USP54-210ENST00000466048 MMP12P39900 470 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP54-210ENST00000466048 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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USP54-210ENST00000466048 GPX3P22352 226 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 GSTM2P28161 218 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 RORCP51449 518 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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