RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465244.1

RBBP7-208, Transcript of RB binding protein 7, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 2

Gene RBBP7, Length 4,031 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7-208ENST00000465244 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 SPATA33Q96N06 139 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 C11orf49Q9H6J7 331 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 NT5DC2Q9H857 520 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.51□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 DBX1A6NMT0 343 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 SLC16A4O15374 487 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 PRAMEF2O60811 474 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 ARIH2O95376 493 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 HPRP00739 348 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 POMCP01189 267 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 CAPN3P20807 821 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 SERPINF1P36955 418 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 SPAM1P38567 509 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 SP4Q02446 784 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 LAPTM4AQ15012 233 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 ZBTB6Q15916 424 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 CDNFQ49AH0 187 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 KLHL22Q53GT1 634 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 LRRC38Q5VT99 294 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 GPAT4Q86UL3 456 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 CD101Q93033 1021 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 RNF34Q969K3 372 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 ULK4Q96C45 1275 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 TMEM209Q96SK2 561 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 IFT27Q9BW83 186 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 PRO1933Q9H354 126 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 RGS18Q9NS28 235 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 KIF25Q9UIL4 384 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 NUDT19A8MXV4 375 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 ADAM10O14672 748 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 TFP02787 698 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 ADH1AP07327 375 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 PAX6P26367 422 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 ADRA1BP35368 520 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 CDH8P55286 799 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 ITKQ08881 620 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 PTP4A2Q12974 167 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 UGCGQ16739 394 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 PFKFB4Q16877 469 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 GPR33Q49SQ1 333 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 LIPNQ5VXI9 398 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 LHX8Q68G74 356 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 LCN8Q6JVE9 175 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 RNF180Q86T96 592 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 KCNMB4Q86W47 210 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 GHDCQ8N2G8 530 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 BEST4Q8NFU0 473 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 FAM84AQ96KN4 292 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 NTMT1Q9BV86 223 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 BTRCQ9Y297 605 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 OGTO15294 1046 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 PCDHGA12O60330 932 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 LILRB5O75023 590 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 SLC43A1O75387 559 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 LTFP02788 710 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 CAPNS1P04632 268 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 CPB1P15086 417 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 NQO2P16083 231 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 UGT2B7P16662 529 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 KDELR1P24390 212 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 TSPAN7P41732 249 aa6.5□□□□□ -1.37
RBBP7-208ENST00000465244 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms