RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465122.5

PDCD6IP-208, Transcript of programmed cell death 6 interacting protein, human

TSL 3

Gene PDCD6IP, Length 894 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PHOX2A	O14813	284 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	VEGFD	O43915	354 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ACSL4	O60488	711 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KRT33A	O76009	404 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SEC24A	O95486	1093 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	YES1	P07947	543 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TPM2	P07951	284 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CASQ1	P31415	396 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	OR3A3	P47888	321 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ABR	Q12979	859 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LY6D	Q14210	128 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MAPK11	Q15759	364 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	AGAP6	Q5VW22	663 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC34A3	Q8N130	599 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GPD1L	Q8N335	351 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SMYD1	Q8NB12	490 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	OR1L3	Q8NH93	324 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SAP25	Q8TEE9	199 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CYYR1	Q96J86	154 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	IDI2	Q9BXS1	227 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TRIM7	Q9C029	511 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	IL36A	Q9UHA7	158 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ABCC9	O60706	1549 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MTMR11	A4FU01	709 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	C19orf81	C9J6K1	198 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CCDC159	P0C7I6	412 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KRT3	P12035	628 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GP9	P14770	177 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SRD5A2	P31213	254 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CD151	P48509	253 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	UCP2	P55851	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FKBP1B	P68106	108 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GUCY2D	Q02846	1103 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC3A1	Q07837	685 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMED1	Q13445	227 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	STXBP2	Q15833	593 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZNF74	Q16587	644 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CES4A	Q5XG92	561 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RAB12	Q6IQ22	244 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ASPG	Q86U10	573 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122		Q8N7P7	452 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RFT1	Q96AA3	541 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	C10orf90	Q96M02	699 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LPAR4	Q99677	370 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NAPB	Q9H115	298 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	EXOC1	Q9NV70	894 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	COMMD8	Q9NX08	183 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MAGEB16	A2A368	324 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		3.11	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.5 ms