RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451422.1

ANKRD28-204, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 2,485 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-204ENST00000451422 MYO9BQ13459 2157 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ALPK3Q96L96 1907 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 H7BY64 318 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 PLPP1O14494 284 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 LATO43561 262 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 SERPIND1P05546 499 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 STSP08842 583 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 HSMCR30P0CW71 290 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 MYOGP15173 224 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 WASP42768 502 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 MAPK9P45984 424 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 CRISP3P54108 245 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ELP6Q0PNE2 266 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 HSPB3Q12988 150 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF234Q14588 700 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 INAQ16352 499 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 DGUOKQ16854 277 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 SZRD1Q7Z422 152 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 OXR1Q8N573 874 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 OR2L2Q8NH16 312 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 GGHQ92820 318 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 UCN3Q969E3 161 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 PRAP1Q96NZ9 151 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 DYRK4Q9NR20 520 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ACER3Q9NUN7 267 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 DEC1Q9P2X7 70 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 CKAP5Q14008 2032 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 TRPM6Q9BX84 2022 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 WASHC1A8K0Z3 465 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 M0R082 166 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 KIAA0355O15063 1070 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 SCAMP1O15126 338 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 PI15O43692 258 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 BCHEP06276 602 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 GADD45AP24522 165 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 CTSKP43235 329 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 NUBP1P53384 320 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 MAPK12P53778 367 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 DSTNP60981 165 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 CD300CQ08708 224 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 DNASE1L3Q13609 305 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 LEXMQ3ZCV2 418 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 CEACAM20Q6UY09 585 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 HMGN2P46Q86SG4 172 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF605Q86T29 641 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 AMZ2Q86W34 360 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 HORMAD2Q8N7B1 307 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 AQP11Q8NBQ7 271 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 HCAR2Q8TDS4 363 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 BADQ92934 168 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 BTBD2Q9BX70 525 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-204ENST00000451422 ITPAQ9BY32 194 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms