RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437652.5

UBAP2L-209, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, humanhuman

TSL 3

Gene UBAP2L, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2L-209ENST00000437652 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa24.37■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 PKDREJQ9NTG1 2253 aa24.37■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 PRRG2O14669 202 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 PRAMEF4O60810 478 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CTNSO60931 367 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 PPP2R1BP30154 601 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 MEOX1P50221 254 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 PLTPP55058 493 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 LIM2P55344 173 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CHIT1Q13231 466 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP24.36■■□□□ 1.495e-7■■■□□ 17.6
UBAP2L-209ENST00000437652 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 VN1R5Q7Z5H4 357 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CLNKQ7Z7G1 428 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 PDPRQ8NCN5 879 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 TMEM52Q8NDY8 209 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 STAG3L4Q8TBR4 150 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 EXT2Q93063 718 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CD244Q9BZW8 370 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 ROGDIQ9GZN7 287 aa24.36■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CYR61O00622 381 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 FANCGO15287 622 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 PEX1O43933 1283 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 COX6B1P14854 86 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CERS1P27544 350 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 SSR4P51571 173 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 GPR143P51810 404 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 GPX6P59796 221 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 HSF1Q00613 529 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CAV1Q03135 178 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 C2orf54Q08AI8 447 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 STX4Q12846 297 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CCDC25Q86WR0 208 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 EID3Q8N140 333 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 PPM1NQ8N819 430 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 PRDM7Q9NQW5 492 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 GRHL1Q9NZI5 618 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 ERVK-11Q9UQG0 969 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 ABCA12Q86UK0 2595 aa24.35■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 APCP25054 2843 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 TGFBR3LH3BV60 316 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 TFECO14948 347 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 ZNHIT1O43257 154 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 TNNI3P19429 210 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CASQ1P31415 396 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 KCNC1P48547 511 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 ADNP2Q6IQ32 1131 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 DOLPP1Q86YN1 238 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 AGAP11Q8TF27 550 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 UBE2E3Q969T4 207 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 KCNC2Q96PR1 638 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 ALG9Q9H6U8 611 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 NMRAL1Q9HBL8 299 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CLDN16Q9Y5I7 305 aa24.34■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 FAM155BO75949 473 aa24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 MSH2P43246 934 aa24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 TBCCQ15814 346 aa24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 CHSY3Q70JA7 882 aa24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 PHF12Q96QT6 1004 aa24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 TBCDQ9BTW9 1192 aa24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 RAB17Q9H0T7 212 aa24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 VTI1BQ9UEU0 232 aa24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 SPACA6W5XKT8 324 aa24.33■■□□□ 1.49
UBAP2L-209ENST00000437652 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 CLDN14O95500 239 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 TFEBP19484 476 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 CD22P20273 847 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 CRABP2P29373 138 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 PTGER4P35408 488 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 RFC3P40938 356 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 CASP2P42575 452 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 MAGEA4P43358 317 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 SLMAPQ14BN4 828 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 AP5B1Q2VPB7 878 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 HSDL2Q6YN16 418 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 MDGA2Q7Z553 956 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 ISCA2Q86U28 154 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 FBF1Q8TES7 1133 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 ASB15Q8WXK1 588 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 CSF3RQ99062 836 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 LYRM4Q9HD34 91 aa24.32■■□□□ 1.48
UBAP2L-209ENST00000437652 NUDT4Q9NZJ9 180 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms