RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 FBXO27Q8NI29 283 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 C15orf40Q8WUR7 153 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 SUV39H2Q9H5I1 410 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 FAM118AQ9NWS6 357 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 VNN3Q9NY84 501 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 NHSL1Q5SYE7 1610 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CBLP22681 906 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 HSD11B1P28845 292 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ATP4BP51164 291 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 OR4D2P58180 307 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RELL1Q8IUW5 271 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ZFP41Q8N8Y5 198 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 OTUB2Q96DC9 234 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ZIC5Q96T25 663 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 MGLLQ99685 303 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ARL6Q9H0F7 186 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 OSBPL2Q9H1P3 480 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 SEC61A2Q9H9S3 476 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 COPS7AQ9UBW8 275 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ASB3Q9Y575 518 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CDH10Q9Y6N8 788 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 MYO9BQ13459 2157 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 C5P01031 1676 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CD8B2A6NJW9 211 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 UPK3BL1B0FP48 263 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 UPK3BL2E5RIL1 263 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 F5H0A9 414 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 SLC19A2O60779 497 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CD8BP10966 210 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 EDNRBP24530 442 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 DNAJB13P59910 316 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ENPP2Q13822 863 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ARSIQ5FYB1 569 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 SLC35F5Q8WV83 523 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RDH12Q96NR8 316 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 MGAT4CQ9UBM8 478 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRU-204ENST00000428026 HTR1AP08908 422 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 GADD45AP24522 165 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 S100A12P80511 92 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 NUP188Q5SRE5 1749 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 FCAMRQ8WWV6 532 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 SGCDQ92629 289 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 PLAGL1Q9UM63 463 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 BTAF1O14981 1849 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 GLOD5A6NK44 160 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 EBLN1P0CF75 366 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 ERP29P30040 261 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 CARD16Q5EG05 197 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 VITQ6UXI7 678 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC15Q8TF66 581 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 SHISA4Q96DD7 197 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 CMTM7Q96FZ5 175 aa13.96□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 PRMT3O60678 531 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 NPPAP01160 153 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 LHPPQ9H008 270 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 ALKBH4Q9NXW9 302 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 HOXC12P31275 282 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 HCAR3P49019 387 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 KCNQ1P51787 676 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 RAB8AP61006 207 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 HERVK_113Q902F9 699 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 NUS1Q96E22 293 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 SCGB3A2Q96PL1 93 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 CD244Q9BZW8 370 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 IL23AQ9NPF7 189 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 MGAT4BQ9UQ53 548 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 SMCO3A2RU48 225 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD66B4E2M5 251 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 WASH3PC4AMC7 463 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 UBXN7O94888 489 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 ITGA5P08648 1049 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 GTF2F2P13984 249 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 SUSD1Q6UWL2 747 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 ASRGL1Q7L266 308 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 ANKFN1Q8N957 763 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 ABCG5Q9H222 651 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRU-204ENST00000428026 NLKQ9UBE8 527 aa13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms