RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF10O60809 474 aa17.86■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF30P17039 623 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 MED22Q15528 200 aa17.86■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 GSTT2BP0CG30 244 aa17.86■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 ACER3Q9NUN7 267 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP6V1HQ9UI12 483 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 NINQ8N4C6 2090 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 ATG13O75143 517 aa17.85■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 TBPL1P62380 186 aa17.85■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 PPCDCQ96CD2 204 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB23Q9ULC3 237 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC88CQ9P219 2028 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 EPOPA6NHQ4 379 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGA2P17301 1181 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 STARD3Q14849 445 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 DESI1Q6ICB0 168 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 BRAT1Q6PJG6 821 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM220Q6QAJ8 160 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP14Q86UN6 197 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa17.85■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 FOPNLQ96NB1 174 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX8Q9Y5X2 465 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 F5P12259 2224 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf16Q68DN1 1984 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC5A10A0PJK1 596 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM227AF5H4B4 570 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 GADD45GO95257 159 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 UGT2B15P54855 530 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF45Q02386 682 aa17.85■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 TSTQ16762 297 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF284Q2VY69 593 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL4Q8N3J2 472 aa17.85■□□□□ 0.45
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SH3BP1-202ENST00000417536 AQP11Q8NBQ7 271 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 PIP5K1AQ99755 562 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 THSD1Q9NS62 852 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 A3GALT2U3KPV4 340 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF197O14709 1029 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 FURINP09958 794 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 TAS2R50P59544 299 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC42P60953 191 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKCDQ05655 676 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 C12orf40Q86WS4 652 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.456e-13■■■■■ 31.9
SH3BP1-202ENST00000417536 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 EHD1Q9H4M9 534 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 ZW10O43264 779 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0513O60268 411 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNB2O95067 398 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-202ENST00000417536 MED26O95402 600 aa17.84■□□□□ 0.45
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