RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 C5orf34Q96MH7 638 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ZNF778Q96MU6 729 aa9.45□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 GRK6P43250 576 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SOX2P48431 317 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 HK3P52790 923 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 FAM189BP81408 668 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TMEM135Q86UB9 458 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SLC35F5Q8WV83 523 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SGTBQ96EQ0 304 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SYT4Q9H2B2 425 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 FBXO10Q9UK96 956 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ALX3O95076 343 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 AGTR1P30556 359 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ALG11Q2TAA5 492 aa9.44□□□□□ -0.9
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HERC3-202ENST00000402738 ESX1Q8N693 406 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 NETO1Q8TDF5 533 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 MUL1Q969V5 352 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 POLHQ9Y253 713 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GVT2 93 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TMEM221A6NGB7 291 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SOBPA7XYQ1 873 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 M0R129 80 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 IRAK2O43187 625 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 HCRTO43612 131 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 AP1G1O43747 822 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 KRT33AO76009 404 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 BCKDHAP12694 445 aa9.44□□□□□ -0.9
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HERC3-202ENST00000402738 ACVR1BP36896 505 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 CLCNKBP51801 687 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ST3GAL3Q11203 375 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 EIPR1Q53HC9 387 aa9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 REEP3Q6NUK4 255 aa9.44□□□□□ -0.9
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HERC3-202ENST00000402738 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.44□□□□□ -0.9
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HERC3-202ENST00000402738 FAM205BPQ63HN1 556 aa9.44□□□□□ -0.9
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HERC3-202ENST00000402738 E7EQ34 232 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 GOSR2O14653 212 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 OIP5O43482 229 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 MSCO60682 206 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PIGRP01833 764 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TFPIP10646 304 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ETV1P50549 477 aa9.43□□□□□ -0.9
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HERC3-202ENST00000402738 LRRC73Q5JTD7 316 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 OR4M2Q8NGB6 313 aa9.43□□□□□ -0.9
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HERC3-202ENST00000402738 TESCQ96BS2 214 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TXNDC15Q96J42 360 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 CD244Q9BZW8 370 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 MYH7P12883 1935 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 TREHO43280 583 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 UBXN7O94888 489 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 IL3P08700 152 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 ALPIP09923 528 aa9.43□□□□□ -0.9
HERC3-202ENST00000402738 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
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