RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 BTDP43251 543 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NUMBP49757 651 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NDST2P52849 883 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 IST1P53990 364 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PLTPP55058 493 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 STX1BP61266 288 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 COG7P83436 770 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TFAP4Q01664 338 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 RAD51Q06609 339 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CHRNDQ07001 517 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 IDI1Q13907 227 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 KCNC3Q14003 757 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ALX1Q15699 326 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 IL17AQ16552 155 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CBWD5Q5RIA9 395 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TTC27Q6P3X3 843 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SH2D5Q6ZV89 423 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CENPUQ71F23 418 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GPR141Q7Z602 305 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 C11orf96Q7Z7L8 435 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PCGF5Q86SE9 256 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF584Q8IVC4 421 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SYCE1Q8N0S2 351 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF614Q8N883 585 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NCOA7Q8NI08 942 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC15Q8TF66 581 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD49Q8WVL7 239 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PDXPQ96GD0 296 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF597Q96LX8 424 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 COG8Q96MW5 612 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 DACH2Q96NX9 599 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 OPALINQ96PE5 141 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 VPS35Q96QK1 796 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NUP85Q9BW27 656 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 AP1M1Q9BXS5 423 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CALN1Q9BXU9 219 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GOLPH3Q9H4A6 298 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 Q9H521 79 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC19Q9H756 370 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SP140LQ9H930 580 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NANOGQ9H9S0 305 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 UGT1A7Q9HAW7 530 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 UGT1A10Q9HAW8 530 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 UGT1A8Q9HAW9 530 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 LY9Q9HBG7 655 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 DIABLOQ9NR28 239 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GDAP2Q9NXN4 497 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NINJ2Q9NZG7 142 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NPAP1Q9NZP6 1156 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TAGLN3Q9UI15 199 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 APPL1Q9UKG1 709 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NUP50Q9UKX7 468 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 RIPK3Q9Y572 518 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 AP4B1Q9Y6B7 739 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 MAU2Q9Y6X3 613 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 FLT1P17948 1338 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NRAPQ86VF7 1730 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 LTN1O94822 1766 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ARID2Q68CP9 1835 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 DIP2BQ9P265 1576 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PAPPAQ13219 1627 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SMIM23A6NLE4 172 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SNTNA6NMZ2 147 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 EVPLLA8MZ36 301 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 KLLNB2CW77 178 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD63C9JTQ0 380 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 H0YC42 278 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TM9SF1O15321 606 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ZW10O43264 779 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TOM1O60784 492 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CIB2O75838 187 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CLPXO76031 633 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 MYO1DO94832 1006 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PAHP00439 452 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 DDX5P17844 614 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PSMA3P25788 255 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 RPA1P27694 616 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ADSSP30520 456 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.8 ms