RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SSC4DQ8WTU2 575 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 DCAKDQ8WVC6 231 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 HAS2Q92819 552 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PRR14Q9BWN1 585 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PARD6BQ9BYG5 372 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 KCNK13Q9HB14 408 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MMP25Q9NPA2 562 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SENP1Q9P0U3 644 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ABI3Q9P2A4 366 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 OPTCQ9UBM4 332 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 HMX2A2RU54 273 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SAGE2PA6NJ88 616 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 FAM227AF5H4B4 570 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 K7EPI3 171 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 B3GALT2O43825 422 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEF2O60811 474 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM24O75264 130 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GP1BBP13224 206 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GFAPP14136 432 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 EDN3P14138 238 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 EPB42P16452 691 aa7.18□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 TAC1P20366 129 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CERS1P27544 350 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CASP2P42575 452 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 CCT5P48643 541 aa7.18□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R50P59544 299 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 BTG2P78543 158 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TGM3Q08188 693 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 E2F2Q14209 437 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TBCCQ15814 346 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MEP1AQ16819 746 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SLC5A8Q8N695 610 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 FAM47BQ8NA70 645 aa7.18□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 KCNC2Q96PR1 638 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TAAR6Q96RI8 345 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SERINC2Q96SA4 455 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 NPAS2Q99743 824 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.18□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 VPS11Q9H270 941 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 OLAHQ9NV23 265 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 STMN3Q9NZ72 180 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MID2Q9UJV3 735 aa7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MAN1A2O60476 641 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MYZAPP0CAP1 466 aa7.17□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 PCNAP12004 261 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 MTHFD2P13995 350 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINB1P30740 379 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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SGMS1-201ENST00000361543 MTTPP55157 894 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 HSD17B7P56937 341 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RAB38P57729 211 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TUBA3CQ13748 450 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 RUNX2Q13950 521 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 SETDB1Q15047 1291 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 TERF2Q15554 542 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 PFKFB4Q16877 469 aa7.17□□□□□ -1.26
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF766Q5HY98 468 aa7.17□□□□□ -1.26
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