RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357714.5

CD46-204, Transcript of CD46 molecule, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CD46, Length 3,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46-204ENST00000357714 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 PHC2Q8IXK0 858 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 ASIC4Q96FT7 647 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 ZIC5Q96T25 663 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 MCUBQ9NWR8 336 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.36□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 PLXNB2O15031 1838 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 TRBC2A0A5B9 178 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 C1orf226A1L170 272 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 K7ERQ8 282 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 OR10H3O60404 316 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 PRAMEF10O60809 474 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 TSPAN9O75954 239 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 GJB5O95377 273 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 CD160O95971 181 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 IFNW1P05000 195 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 HBQ1P09105 142 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 SDC2P34741 201 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 SOAT1P35610 550 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 SPAM1P38567 509 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 ASMTP46597 345 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 CDK6Q00534 326 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 MFSD14CQ5VZR4 134 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 GLRX5Q86SX6 157 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 Q8N402 240 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 PMEPA1Q969W9 287 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 NELL2Q99435 816 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 SLC35A5Q9BS91 424 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 CHST8Q9H2A9 424 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 NIPAL2Q9H841 368 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 LHX3Q9UBR4 397 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 BTNL2Q9UIR0 455 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 MYADML2A6NDP7 307 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 BNIP3LO60238 219 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 FZD6O60353 706 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 TPST2O60704 377 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 IL1AP01583 271 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 C1QBP02746 253 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 CBSLP0DN79 551 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 ATF6P18850 670 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 CBSP35520 551 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 GSTM5P46439 218 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 SLC9A3P48764 834 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 HNMTP50135 292 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 ZNF91Q05481 1191 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 BCL2L1Q07817 233 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 IL18Q14116 193 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 ARHGEF6Q15052 776 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 GPR33Q49SQ1 333 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 ESCO2Q56NI9 601 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 ESX1Q8N693 406 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 AP3S1Q92572 193 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 PHF21AQ96BD5 680 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 MED8Q96G25 268 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 KCTD7Q96MP8 289 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 P2RY13Q9BPV8 354 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 THSD1Q9NS62 852 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 ENPP4Q9Y6X5 453 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 GBF1Q92538 1859 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.35□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 C2orf78A6NCI8 922 aa7.34□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 C6orf47O95873 294 aa7.34□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 KLKB1P03952 638 aa7.34□□□□□ -1.23
CD46-204ENST00000357714 C8GP07360 202 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms