RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356175.7

NF1-201, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 12,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-201ENST00000356175 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 K7ERQ8 282 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 C8BP07358 591 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 NR2F1P10589 423 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 RAB28P51157 221 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 MGAT3Q09327 533 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 SNAPC2Q13487 334 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 GAB2Q9UQC2 676 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 DFFBO76075 338 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 ACADMP11310 421 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 MVKQ03426 396 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.352e-6■■■■□ 21.4
NF1-201ENST00000356175 SELENBP1Q13228 472 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 ENPP2Q13822 863 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 CGB2Q6NT52 195 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 KCT2Q8NC54 265 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 FAM110BQ8TC76 370 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 MFFQ9GZY8 342 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 DAPL1A0PJW8 107 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 F5H5P2 479 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 HCN1O60741 890 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 IFNA2P01563 188 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 BCKDHAP12694 445 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 CAPN3P20807 821 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 ALDH1B1P30837 517 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 CSF2RBP32927 897 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 VLDLRP98155 873 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 CPTPQ5TA50 214 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 CST9LP1Q5W188 147 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 NELL2Q99435 816 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 FAM227AF5H4B4 570 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 EPHA5P54756 1037 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 LGI4Q8N135 537 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 RFKQ969G6 155 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 RARRES1P49788 294 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 UFM1P61960 85 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 IFI44LQ53G44 452 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 SYT4Q9H2B2 425 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 PIM2Q9P1W9 311 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.59□□□□□ -1.35
NF1-201ENST00000356175 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 CTDSP2O14595 271 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 GRID2O43424 1007 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 CHST10O43529 356 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 MMP20O60882 483 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 NUDT14O95848 222 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 SYPP08247 313 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 CDK15Q96Q40 435 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 SLC2A1P11166 492 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 EDNRAP25101 427 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 BAG6P46379 1132 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 DIO1P49895 249 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 GATMP50440 423 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 ATP6V0D1P61421 351 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 CREMQ03060 361 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 NPRL3Q12980 569 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 ATP6AP1Q15904 470 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 GPR157Q5UAW9 335 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 LIPIQ6XZB0 460 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.59□□□□□ -1.36
NF1-201ENST00000356175 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.6 ms