RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 SLC37A3Q8NCC5 494 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 CHTF18Q8WVB6 975 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 MAL2Q969L2 176 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 WWOXQ9NZC7 414 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 SRRDQ9UH36 339 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 KLKB1P03952 638 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 FAM157BP0CG42 384 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 SRCP12931 536 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 SELPP16109 830 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 SDC1P18827 310 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 OR1D2P34982 312 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 TTPAP49638 278 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 ZXDBP98169 803 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 LIPKQ5VXJ0 399 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 MZT2BQ6NZ67 158 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 DUSP18Q8NEJ0 188 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 WBP2Q969T9 261 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 GPR137Q96N19 417 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 SPNS1Q9H2V7 528 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.1■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 PCDH17O14917 1159 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 LYRM1O43325 122 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 MSL3P1P0C860 447 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 CDH18Q13634 790 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 GALEQ14376 348 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 DUOXA1Q1HG43 343 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 HKDC1Q2TB90 917 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 Q8N402 240 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 22.6
GDE1-201ENST00000353258 USP7Q93009 1102 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 TESCQ96BS2 214 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 AP2M1Q96CW1 435 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 TRIB3Q96RU7 358 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 CLN6Q9NWW5 311 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 NDUFB11Q9NX14 153 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 SH3D21A4FU49 640 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 MAGEB17A8MXT2 336 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 TMEM229AB2RXF0 380 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 ORC5O43913 435 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 PLOD3O60568 738 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 TPST2O60704 377 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 OPN1SWP03999 348 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 PRKAR1AP10644 381 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 ANGPT1Q15389 498 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 KIF18BQ86Y91 864 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 BBS7Q8IWZ6 715 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 PHF21AQ96BD5 680 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 SCLYQ96I15 445 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 IL4I1Q96RQ9 567 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 CHD5Q8TDI0 1954 aa16.09■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 COCHO43405 550 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 HCN1O60741 890 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 HBQ1P09105 142 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 OR1E2P47887 323 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 ABATP80404 500 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 C22orf42Q6IC83 251 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 C16orf62Q7Z3J2 963 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 OR4C15Q8NGM1 316 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 TMEM203Q969S6 136 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 MTERF3Q96E29 417 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 MGME1Q9BQP7 344 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 MARVELD1Q9BSK0 173 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 SH3BP4Q9P0V3 963 aa16.08■□□□□ 0.17
GDE1-201ENST00000353258 LGI1O95970 557 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 PDYNP01213 254 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 PRLP01236 227 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 RHOCP08134 193 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 SLC11A2P49281 568 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 AANATQ16613 207 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 MICAQ29983 383 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 LHX8Q68G74 356 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 CLECL1Q8IZS7 167 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 DOHHQ9BU89 302 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 ANKRA2Q9H9E1 313 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 H3BNC9 293 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 INSIG1O15503 277 aa16.08■□□□□ 0.16
GDE1-201ENST00000353258 ENTPD6O75354 484 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms