RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SFXN1Q9H9B4 322 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 DZANK1Q9NVP4 752 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 A6NCN8 305 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 C8BP07358 591 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ACADVLP49748 655 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 RHDQ02161 417 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TRAM1L1Q8N609 369 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 FUZQ9BT04 418 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 CREBZFQ9NS37 354 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 H3BSA7 217 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 E2F3O00716 465 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 JUNDP17535 347 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 GALNT12Q8IXK2 581 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 MOCOSQ96EN8 888 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ERVK-18Q9QC07 812 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 APOL3O95236 402 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ADH7P40394 386 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SLC18A2Q05940 514 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ASB6Q9NWX5 421 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NLGN4XQ8N0W4 816 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 MRGPRX2Q96LB1 330 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 LTN1O94822 1766 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SOCS5O75159 536 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 RFPL2O75678 378 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 DIO3P55073 304 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 DEFB134Q4QY38 66 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 IL22RA1Q8N6P7 574 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NINJ1Q92982 152 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF12P17014 697 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 OARD1Q9Y530 152 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 HLA-DPB1P04440 258 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 GLDCP23378 1020 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 HERV-K104P61576 105 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 CARM1Q86X55 608 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ABCD2Q9UBJ2 740 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A25Q6KCM7 469 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 UBQLNLQ8IYU4 475 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 CASTOR1Q8WTX7 329 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ALG5Q9Y673 324 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 GRPRP30550 384 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NCEH1Q6PIU2 408 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 DENND6BQ8NEG7 585 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 OR10T2Q8NGX3 314 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 GLS2Q9UI32 602 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 MT-ND5P03915 603 aa21.52■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa21.52■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 AOC1P19801 751 aa21.52■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 PLCXD2Q0VAA5 305 aa21.52■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 PACRGLQ8N7B6 248 aa21.52■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 THAP6Q8TBB0 222 aa21.52■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.52■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa21.52■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PPK0 400 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 CLIC3O95833 236 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 CSTAP01040 98 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 GLP1RP43220 463 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 SEC23BQ15437 767 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 LIPJQ5W064 366 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 USP53Q70EK8 1073 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 SIGLEC10Q96LC7 697 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 CD1DP15813 335 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 SARDHQ9UL12 918 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 IFT172Q9UG01 1749 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 K7ERQ8 282 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 ELK4P28324 431 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 TBPL1P62380 186 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 PON2Q15165 354 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 ZBED5Q49AG3 693 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 ERMP1Q7Z2K6 904 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 TIFABQ6ZNK6 161 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 OTUB2Q96DC9 234 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF350Q9GZX5 532 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 KCNS2Q9ULS6 477 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 GPR32O75388 356 aa21.51■■□□□ 1.03
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