RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 NPIPA2E9PIF3 369 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 STX16O14662 325 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 DLEU1O43261 78 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SELENOFO60613 162 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RFPL1O75677 317 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ANGPTL1O95841 491 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MAGP20916 626 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GPD1P21695 349 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MIPP30301 263 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SDC4P31431 198 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SPRP35270 261 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FLT3LGP49771 235 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SUOXP51687 545 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ARSEP51690 589 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GPS1Q13098 491 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 DGCR6Q14129 220 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SV2CQ496J9 727 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 IZUMO3Q5VZ72 239 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 WSCD1Q658N2 575 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SPNS3Q6ZMD2 512 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF765Q7L2R6 523 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ART4Q93070 314 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GPR137Q96N19 417 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 EVA1AQ9H8M9 152 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SIRT7Q9NRC8 400 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FBXL12Q9NXK8 326 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GHRLQ9UBU3 117 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 LGALS13Q9UHV8 139 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 OGDHLQ9ULD0 1010 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SCN1AP35498 2009 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TRIP11Q15643 1979 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ANK1P16157 1881 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MYADML2A6NDP7 307 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 DUXAA6NLW8 204 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 H0YAE9 185 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 HAS3O00219 553 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 QSOX1O00391 747 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ARPC5O15511 151 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 LIASO43766 372 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TBC1D4O60343 1298 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SDC3O75056 442 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ABLIM3O94929 683 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CDKN2BP42772 138 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GRIA4P48058 902 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MECP2P51608 486 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SLC1A5Q15758 541 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 FAM83EQ2M2I3 478 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 HACD4Q5VWC8 232 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PGAP1Q75T13 922 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TAF8Q7Z7C8 310 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 UNC93AQ86WB7 457 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 KLBQ86Z14 1044 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CMIPQ8IY22 773 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CDK20Q8IZL9 346 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 PRSS35Q8N3Z0 413 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MRGPRDQ8TDS7 321 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GLYATL2Q8WU03 294 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RXFP2Q8WXD0 754 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZFP42Q96MM3 310 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 GLT1D1Q96MS3 346 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 IFT27Q9BW83 186 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SOHLH2Q9NX45 425 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 RDH8Q9NYR8 311 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 CLDN16Q9Y5I7 305 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 A0A1W2PPH5 198 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 SUV39H1O43463 412 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ITGA10O75578 1167 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 AHSA1O95433 338 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 LCP1P13796 627 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms