RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 STK32CQ86UX6 486 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 UCN3Q969E3 161 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 A0A1W2PR77 199 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 GSAPA4D1B5 854 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 LRIT2A6NDA9 550 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TMPRSS11DO60235 418 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SEMA3DO95025 777 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TFAP2AP05549 437 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ATP6V1B1P15313 513 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CD38P28907 300 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 KDELR2P33947 212 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SPIDRQ14159 915 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 VTCN1Q7Z7D3 282 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 FAM46DQ8NEK8 389 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 OR5AK3PQ8NH89 298 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 OR2A14Q96R47 310 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 C8orf4Q9NR00 106 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ATAD3AQ9NVI7 634 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 VNN3Q9NY84 501 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 AHSPQ9NZD4 102 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 C5AR2Q9P296 337 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 GMEB1Q9Y692 573 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 PRAMEF10O60809 474 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CLEC3AO75596 197 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 IL1RNP18510 177 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 MAGP20916 626 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 GRK3P35626 688 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 MAPK12P53778 367 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 APOFQ13790 326 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 DAG1Q14118 895 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 KRT80Q6KB66 452 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TM4SF18Q96CE8 201 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SMURF2Q9HAU4 748 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SPEGQ15772 3267 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 OR6B1O95007 311 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ALPLP05186 524 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ETFAP13804 333 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 UGT2B7P16662 529 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 MYF6P23409 242 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 NUDT1P36639 197 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ERICH5Q6P6B1 374 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ZNF793Q6ZN11 406 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 RGMAQ96B86 450 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ABCG2Q9UNQ0 655 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.3■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 B4DGG1 531 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 K7ESF4 209 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 AQP1P29972 269 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 MAGEA2P43356 314 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ZIC1Q15915 447 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 IKBIPQ70UQ0 350 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 PAQR7Q86WK9 346 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CD320Q9NPF0 282 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.29■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SEMG1P04279 462 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CAPGP40121 348 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ALDH3A2P51648 485 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 PPP1CAP62136 330 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TSSK4Q6SA08 328 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 EID3Q8N140 333 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 MTERF3Q96E29 417 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 MIEF1Q9NQG6 463 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ACTR10Q9NZ32 417 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 U3KQV3 271 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 A0A1W2PRB8 838 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 G3V2T6 193 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 H3BNH8 94 aa20.28■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms