RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN6O43657 245 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GKP32189 559 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GXYLT1Q4G148 440 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 DLK2Q6UY11 383 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 OR51G2Q8NGK0 314 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 I3L521 148 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GALTP07902 379 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN8P56748 225 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 RAB7BQ96AH8 199 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 IGSF21Q96ID5 467 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 LAMP5Q9UJQ1 280 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 LEFTY1O75610 366 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ERP29P30040 261 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PIGGQ5H8A4 983 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T33Q8NG76 320 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 OR4K17Q8NGC6 315 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SCAMP4Q969E2 229 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 RNF121Q9H920 327 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TLR9Q9NR96 1032 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-18Q9QC07 812 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ST14Q9Y5Y6 855 aa20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CDKN2DP55273 166 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS12Q96DT0 336 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 RBP7Q96R05 134 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 DISC1C4P0D8 188 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HOXB2P14652 356 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 DCKP27707 260 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 NPRL3Q12980 569 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ABRAXAS2Q15018 415 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ASRGL1Q7L266 308 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 NEIL3Q8TAT5 605 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JPF8 293 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 FGF18O76093 207 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GJB5O95377 273 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MT-ND2P03891 347 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 IL3P08700 152 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ACTC1P68032 377 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ACTA1P68133 377 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ALKBH4Q9NXW9 302 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 NUP50Q9UKX7 468 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 WASHC1A8K0Z3 465 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 WASH3PC4AMC7 463 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 LCN1P31025 176 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GRK5P34947 590 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 OR4D2P58180 307 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 RFT1Q96AA3 541 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 L3HYPDHQ96EM0 354 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 EXTL2Q9UBQ6 330 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 AURKAO14965 403 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CD9P21926 228 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CASRP41180 1078 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN10P78369 228 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 TMED4Q7Z7H5 227 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.842e-9■■■□□ 19.1
CCSAP-201ENST00000284617 PMM1Q92871 262 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 MGLLQ99685 303 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 HPF1Q9NWY4 346 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 GLOD5A6NK44 160 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 RHCEP18577 417 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ETV3P41162 512 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CRISP1P54107 249 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 CLCA4Q14CN2 919 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 NSMAFQ92636 917 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 FAM118AQ9NWS6 357 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 KLRF1Q9NZS2 232 aa20.32■□□□□ 0.84
CCSAP-201ENST00000284617 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms