RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RhdQ8CF94 418 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr315Q8VFG7 309 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr666Q8VH00 318 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr146Q99LE2 333 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spcs2Q9CYN2 226 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Senp8Q9D2Z4 221 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stx11Q9D3G5 287 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plod2Q9R0B9 737 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fads2Q9Z0R9 444 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sema4fQ9Z123 777 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lzts3A2AHG0 700 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zcchc7B1AX39 541 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm19965J3QNY8 723 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Man2b2O54782 1018 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sap18O55128 153 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AmbnO55189 407 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr50O88495 591 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stk16O88697 305 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc22a8O88909 537 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acvr2aP27038 513 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Emp1P47801 160 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defb23Q30KP0 166 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem38aQ3TMP8 298 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Xrra1Q3U3V8 786 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr320Q7TRZ4 306 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptbp3Q8BHD7 523 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccm2Q8K2Y9 453 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Retreg1dQ8VE91 480 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr77Q8VEY9 312 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1033Q8VFK5 310 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnase1l2Q9D1G0 278 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DlstQ9D2G2 454 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trpv4Q9EPK8 871 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PrelpQ9JK53 378 aa20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm6685D3YYP3 228 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tcp10cE9Q046 482 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igfbp2P47877 305 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cds1P98191 461 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pou1f1Q00286 291 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ankrd27Q3UMR0 1048 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbbp4Q60972 425 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krba1Q6NXZ1 1043 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gramd2bQ6PEM6 445 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FbrsQ8R089 466 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RorbQ8R1B8 470 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr353Q8VGK0 311 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Riok2Q9CQS5 547 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GabarapQ9DCD6 117 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KelQ9EQF2 713 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mid2Q9QUS6 705 aa20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Anapc1P53995 1944 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BC024063A0A1W2P7G7 749 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AU018091E9PWS4 684 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A530032D15RikE9Q422 215 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm14139F6ZS36 494 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r97K7N6Z2 861 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r92L7N2A4 860 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ikzf3O08900 507 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2-AaP01910 256 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rb1P13405 921 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ube2e3P52483 207 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp39Q02525 718 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igfbp5Q07079 271 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr165Q3V3A3 455 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnh1Q60603 989 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gas6Q61592 674 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GcgrQ61606 485 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bpifb2Q8C1E1 462 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prkd3Q8K1Y2 889 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem203Q8R235 136 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arrb2Q91YI4 410 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Twist2Q9D030 160 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fabp12Q9DAK4 132 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Thbs4Q9Z1T2 963 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp808B8JJZ4 753 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EXOC1LB9EK06 172 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RngttO55236 597 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akap3O88987 864 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccnb2P30276 398 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gal3st3P61315 431 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fgf13P70377 245 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C1orf109Q499E6 217 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dcdc2Q5DU00 475 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam20cQ5MJS3 579 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PrlhrQ6VMN6 370 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FukQ7TMC8 1090 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rgs8Q8BXT1 180 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim31Q8R0K2 507 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam20bQ8VCS3 409 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acsl6Q91WC3 697 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TMEM121BQ99MX7 572 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtprsB0V2N1 1907 aa20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5565A0A0G2JGB2 317 aa20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itga10E9Q6R1 1167 aa20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm17615E9Q9P2 165 aa20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pld3O35405 488 aa20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GfapP03995 430 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59 ms