RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 CLEC3AO75596 197 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 CD1DP15813 335 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 GP5P40197 560 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 SPINK14Q6IE38 97 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 HORMAD2Q8N7B1 307 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 ACBD4Q8NC06 268 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 PDPRQ8NCN5 879 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 WDR34Q96EX3 536 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 CAPS2Q9BXY5 557 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 ENKD1Q9H0I2 346 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 DPH5Q9H2P9 285 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 CDCP1Q9H5V8 836 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 CLDN16Q9Y5I7 305 aa20.6■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 LRIT2A6NDA9 550 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 FAM227AF5H4B4 570 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 WISP2O76076 250 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 GSTA2P09210 222 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 MLF1P58340 268 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 ATP6V0D1P61421 351 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 VN1R5Q7Z5H4 357 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 SIAH3Q8IW03 269 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 KRT78Q8N1N4 520 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 APCDD1LQ8NCL9 501 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 POM121Q96HA1 1249 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 UBXN10Q96LJ8 280 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 QRFPRQ96P65 431 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 KLHL1Q9NR64 748 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 DNAJC11Q9NVH1 559 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 WWOXQ9NZC7 414 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 LRFN1Q9P244 771 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 NF1P21359 2839 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 ITPR3Q14573 2671 aa20.59■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 ERI3O43414 337 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 PRAMEF4O60810 478 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 SP1P08047 785 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 CCDC166P0CW27 439 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 CD1EP15812 388 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 STMN1P16949 149 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 OR4D1Q15615 310 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 SLC25A25Q6KCM7 469 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 ZNF227Q86WZ6 799 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 GPSM1Q86YR5 675 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 CYP4X1Q8N118 509 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 EID3Q8N140 333 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 SPATA6LQ8N4H0 392 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 OR2L5Q8NG80 312 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.58■□□□□ 0.89
SRRT-218ENST00000620394 GTF3C1Q12789 2109 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 A0A088AWK7 358 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 NME2P1O60361 137 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 SLC25A12O75746 678 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ABOP16442 354 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 NME2P22392 152 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 RAB38P57729 211 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 GPX6P59796 221 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 BTN3A2P78410 334 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 RUNX2Q13950 521 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 E2F2Q14209 437 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 B3GNT7Q8NFL0 401 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 KIAA1191Q96A73 305 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 FAR2Q96K12 515 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 RHBGQ9H310 441 aa20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 TGFBR3LH3BV60 316 aa20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 STK16O75716 305 aa20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 EPORP19235 508 aa20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CD22P20273 847 aa20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 HSPA7P48741 367 aa20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CYB561P49447 251 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms