RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.59■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 CHRNA1P02708 482 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.886e-6■■■■□ 22.6
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PTPRM-211ENST00000580170 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.57■□□□□ 0.88
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