RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562291.2

INO80E-204, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-204ENST00000562291 SLC25A25Q6KCM7 469 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 CHSY3Q70JA7 882 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 KIF2BQ8N4N8 673 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 PDPRQ8NCN5 879 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 OR2L5Q8NG80 312 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 KCTD4Q8WVF5 259 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 IFT81Q8WYA0 676 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 UBE2E3Q969T4 207 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 WDR34Q96EX3 536 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 QRFPRQ96P65 431 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 SERINC2Q96SA4 455 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 COPG2Q9UBF2 871 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 OPTCQ9UBM4 332 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MMACHCQ9Y4U1 282 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 COL12A1Q99715 3063 aa9.06□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 CACNA1DQ01668 2161 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 SAGE2PA6NJ88 616 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 SYCE1LA8MT33 242 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 K7EPI3 171 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 UBXN8O00124 270 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 CDK2AP1O14519 115 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 CTNSO60931 367 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 KERAO60938 352 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 SH3BGRLO75368 114 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 UNC5CO95185 931 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 CLDN1O95832 211 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 TGFB1P01137 390 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 IFNA16P05015 189 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 SP1P08047 785 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 STSP08842 583 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 EPB42P16452 691 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 TNNI3P19429 210 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 CD22P20273 847 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MST1P26927 711 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 COL8A1P27658 744 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MSH2P43246 934 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 CLCN2P51788 898 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 LIM2P55344 173 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MLF1P58340 268 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 RBPJQ06330 500 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 BMPR2Q13873 1038 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.965e-7■□□□□ 10.5
INO80E-204ENST00000562291 ACAP2Q15057 778 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MED27Q6P2C8 311 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 FJX1Q86VR8 437 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 LGI4Q8N135 537 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 TEX9Q8N6V9 391 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 TMEM178AQ8NBL3 297 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MDS2Q8NDY4 140 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MNS1Q8NEH6 495 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 CCDC77Q9BR77 488 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 TBCDQ9BTW9 1192 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 TSPYL1Q9H0U9 437 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 LRFN1Q9P244 771 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 RELNP78509 3460 aa9.04□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 A0A096LPK6 155 aa9.04□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa9.04□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 CYR61O00622 381 aa9.04□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 FCHO1O14526 889 aa9.04□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 WISP2O76076 250 aa9.04□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MYO1DO94832 1006 aa9.04□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 KLHL2O95198 593 aa9.04□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 MLYCDO95822 493 aa9.04□□□□□ -0.96
INO80E-204ENST00000562291 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms