RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558816.5

SEMA6D-210, Transcript of semaphorin 6D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SEMA6D, Length 4,419 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6D-210ENST00000558816 SBK3P0C264 359 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 RORAP35398 523 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 GPLD1P80108 840 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 CDK3Q00526 305 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 ZNF33BQ06732 778 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 SIGLEC14Q08ET2 396 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 CDKN3Q16667 212 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 DCST1Q5T197 706 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 ENPP6Q6UWR7 440 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.36□□□□□ -1.55
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SEMA6D-210ENST00000558816 UBE2J2Q8N2K1 259 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 LINC00471Q8N535 108 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 C20orf27Q9GZN8 174 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PRSS16Q9NQE7 514 aa5.36□□□□□ -1.55
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SEMA6D-210ENST00000558816 ZNF639Q9UID6 485 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa5.36□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 A0A1B0GVT2 93 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PRSS38A1L453 326 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 ARHGEF33A8MVX0 844 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 CLOCKO15516 846 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 MBTPS2O43462 519 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 INHBBP09529 407 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 DRD2P14416 443 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 HLA-FP30511 346 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 LIMK1P53667 647 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 EMP3P54852 163 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 NSDHLQ15738 373 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 MAPK14Q16539 360 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 ZNF550Q7Z398 422 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 SATL1Q86VE3 508 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PELI3Q8N2H9 469 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 CNTD1Q8N815 330 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 MYADMQ96S97 322 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 RNF38Q9H0F5 515 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PADI1Q9ULC6 663 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 POMPQ9Y244 141 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 A0A1B0GW55 424 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 CIB4A0PJX0 185 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 BTN3A3O00478 584 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PROM1O43490 865 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PRAMEF12O95522 483 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 CPNE6O95741 557 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 IL33O95760 270 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 BMP4P12644 408 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 AHCYP23526 432 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 INHBCP55103 352 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PLCXD2Q0VAA5 305 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 LSAMPQ13449 338 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 GRIN2CQ14957 1233 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 TGFBIQ15582 683 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 OCLNQ16625 522 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 AFMIDQ63HM1 303 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 ZNF440Q8IYI8 595 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 FBXO27Q8NI29 283 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 RBP7Q96R05 134 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 CD244Q9BZW8 370 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 SP140LQ9H930 580 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PELI2Q9HAT8 420 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 DUX4Q9UBX2 424 aa5.35□□□□□ -1.55
SEMA6D-210ENST00000558816 SH3GLB1Q9Y371 365 aa5.35□□□□□ -1.55
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