RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	SCEL	O95171	688 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	HP	P00738	406 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	PCNA	P12004	261 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	ACPP	P15309	386 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	CD97	P48960	835 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	EFNA3	P52797	238 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	MTTP	P55157	894 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	RAB8A	P61006	207 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	BTN3A2	P78410	334 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	CLC	Q05315	142 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549		Q0VFX4	171 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	TRAF3	Q13114	568 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	AMER2	Q8N7J2	671 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	BANP	Q8N9N5	519 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	APOPT1	Q96IL0	206 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	QRFPR	Q96P65	431 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	SMC6	Q96SB8	1091 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF382	Q96SR6	550 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	AICDA	Q9GZX7	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	SNX6	Q9UNH7	406 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	PLLP	Q9Y342	182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	TTLL8	A6PVC2	850 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549		G3V2L1	256 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	DPM1	O60762	260 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	JRK	O75564	520 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	SEMA3D	O95025	777 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	FH	P07954	510 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	ICAM2	P13598	275 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	CPA3	P15088	417 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	ITGA3	P26006	1051 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	PKNOX1	P55347	436 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	RAB38	P57729	211 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF844	Q08AG5	666 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	ASPH	Q12797	758 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	LCP2	Q13094	533 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	IFT88	Q13099	833 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	KRT71	Q3SY84	523 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	UNC50	Q53HI1	259 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	FRG2	Q64ET8	278 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549		Q8NA96	180 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	MIB2	Q96AX9	1013 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	RGMA	Q96B86	450 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	PEX11G	Q96HA9	241 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM237	Q96Q45	408 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	FRG2B	Q96QU4	278 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	SERPINI1	Q99574	410 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	BRF2	Q9HAW0	419 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	LYRM4	Q9HD34	91 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	C5AR2	Q9P296	337 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	OR2W5	A6NFC9	320 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	CLDN4	O14493	209 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	TGFB1	P01137	390 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	HSD3B1	P14060	373 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RBM23-231	ENST00000557549	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55

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