RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 LAMA1P25391 3075 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 CD82P27701 267 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 HPCAL1P37235 193 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 GCGRP47871 477 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 MNAT1P51948 309 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 PDX1P52945 283 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 CLDN8P56748 225 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 BTN3A2P78410 334 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 ABHD18Q0P651 414 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 KCNAB1Q14722 419 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 TERF2Q15554 542 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 HKDC1Q2TB90 917 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.84□□□□□ -0.99
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CS-220ENST00000550700 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 MED25Q71SY5 747 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa8.84□□□□□ -0.99
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CS-220ENST00000550700 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 BMPERQ8N8U9 685 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
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CS-220ENST00000550700 OR1F2PQ96R84 312 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 DPY30Q9C005 99 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 GPR45Q9Y5Y3 372 aa8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CS-220ENST00000550700 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CEP250Q9BV73 2442 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 A0A0A6YYD5 115 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PCDH17O14917 1159 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 P2RX6O15547 441 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ZNF749O43361 778 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NRP2O60462 931 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TBX19O60806 448 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 KLHL18O94889 574 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RNH1P13489 461 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SDC1P18827 310 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ALAS2P22557 587 aa8.83□□□□□ -1
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CS-220ENST00000550700 RAB8AP61006 207 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 DCDP81605 110 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 FOXK1P85037 733 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 STX5Q13190 355 aa8.83□□□□□ -1
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CS-220ENST00000550700 DSG2Q14126 1118 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 MAP7Q14244 749 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 DEFB134Q4QY38 66 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.83□□□□□ -1
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CS-220ENST00000550700 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TESCQ96BS2 214 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
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CS-220ENST00000550700 KLHL31Q9H511 634 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ZNF304Q9HCX3 659 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 MIEF1Q9NQG6 463 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SAR1AQ9NR31 198 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 DAPP1Q9UN19 280 aa8.83□□□□□ -1
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CS-220ENST00000550700 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.83□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SCN3AQ9NY46 2000 aa8.83□□□□□ -1
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CS-220ENST00000550700 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 FAM234BA2RU67 622 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 EBAG9O00559 213 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 FCHO1O14526 889 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NVLO15381 856 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CFLARO15519 480 aa8.82□□□□□ -1
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