RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 CCT6BQ92526 530 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ISL2Q96A47 359 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 MIEF2Q96C03 454 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 PHF21BQ96EK2 531 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 SARGQ9BW04 601 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ZFP69BQ9UJL9 534 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 SEC16AO15027 2179 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 PCNX1Q96RV3 2341 aa9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 CCDC88CQ9P219 2028 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PPM1 405 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ZNF860A6NHJ4 632 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 A6NL46 340 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 VSTM2BA6NLU5 285 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 K7EPI3 171 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 DNAJB6O75190 326 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 RBP1P09455 135 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ZGLP1P0C6A0 271 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 SLC35G6P0C7Q6 338 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 COL6A2P12110 1019 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 CXCR2P25025 360 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 AHRP35869 848 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 HSD17B3P37058 310 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 RAB8AP61006 207 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 IRF8Q02556 426 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 KLC1Q07866 573 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 RGS1Q08116 209 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 PWP1Q13610 501 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ATP1A4Q13733 1029 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 SETDB1Q15047 1291 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 FAAH2Q6GMR7 532 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 RAB43Q86YS6 212 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 KRT78Q8N1N4 520 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 AMER3Q8N944 861 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 Q8NA96 180 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 FKBP10Q96AY3 582 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 MTBPQ96DY7 904 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 C19orf60Q96EN9 201 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 MVB12AQ96EY5 273 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ING2Q9H160 280 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 SLC26A1Q9H2B4 701 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 KLHL31Q9H511 634 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ANKHQ9HCJ1 492 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ACSS2Q9NR19 701 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 XPR1Q9UBH6 696 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 OPTCQ9UBM4 332 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.1□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 FBN3Q75N90 2809 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 TACC2O95359 2948 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 A0A0G2JN53 185 aa9.09□□□□□ -0.95
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CS-217ENST00000550044 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.09□□□□□ -0.95
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CS-217ENST00000550044 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 KLK8O60259 260 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ALOX12BO75342 701 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 RDH16O75452 317 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 JRKO75564 520 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 KLHL18O94889 574 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 NSA2O95478 260 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 EPB42P16452 691 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 CD22P20273 847 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 EMP2P54851 167 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 OLR1P78380 273 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 HYAL2Q12891 473 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 DEFB134Q4QY38 66 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 MRGPREQ86SM8 312 aa9.09□□□□□ -0.95
CS-217ENST00000550044 PDSS2Q86YH6 399 aa9.09□□□□□ -0.95
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