RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	IGFBP4	P22692	258 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	DCT	P40126	519 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	MAP2K4	P45985	399 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	TRPC1	P48995	793 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	IL5RA	Q01344	420 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	OCA2	Q04671	838 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	FPGT	O14772	594 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	YY2	O15391	372 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFS2	O75306	463 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	HPR	P00739	348 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	FMO3	P31513	532 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	HPCAL1	P37235	193 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	IFITM3	Q01628	133 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	KCNC4	Q03721	635 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	VAC14	Q08AM6	782 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	DNASE1L3	Q13609	305 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	DGCR6	Q14129	220 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	SPIDR	Q14159	915 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	KRT78	Q8N1N4	520 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	SMPDL3A	Q92484	453 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	POM121B	A6NF01	834 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	GBA	P04062	536 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	PCMT1	P22061	227 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	PSMB5	P28074	263 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	GZMM	P51124	257 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	RAPSN	Q13702	412 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	CLCA4	Q14CN2	919 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	CPTP	Q5TA50	214 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	MICU2	Q8IYU8	434 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	NETO1	Q8TDF5	533 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	DUSP26	Q9BV47	211 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A1W2PPV9	198 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	PRR19	A6NJB7	356 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	SCAMP1	O15126	338 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	SERPINA1	P01009	418 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFV2	P19404	249 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	CLDN2	P57739	230 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	VBP1	P61758	197 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	PJA1	Q8NG27	643 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	FGF22	Q9HCT0	170 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	VNN3	Q9NY84	501 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	PCM1	Q15154	2024 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	COL4A2	P08572	1712 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	KCNJ13	O60928	360 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	UGT2B11	O75310	529 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	IDS	P22304	550 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	ACSL1	P33121	698 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC14A1	Q13336	389 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	EID3	Q8N140	333 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	WDR48	Q8TAF3	677 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	C17orf50	Q8WW18	174 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	ASB12	Q8WXK4	309 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	DNASE1L2	Q92874	299 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		15	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
GRSF1-208	ENST00000545193	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms