RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 PFKFB4Q16877 469 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 ACER2Q5QJU3 275 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 GRHL2Q6ISB3 625 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 FAM180AQ6UWF9 173 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 CRLF3Q8IUI8 442 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 IFT20Q8IY31 132 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 BEST3Q8N1M1 668 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 SLC5A8Q8N695 610 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TEX9Q8N6V9 391 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 BCORP1Q8N888 145 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 SUN3Q8TAQ9 357 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 ELP5Q8TE02 316 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 FAR1Q8WVX9 515 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 KCNC2Q96PR1 638 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 F2RL3Q96RI0 385 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 MS4A8Q9BY19 250 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 ROGDIQ9GZN7 287 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 ADGRE2Q9UHX3 823 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 DAPP1Q9UN19 280 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 CLDN4O14493 209 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 AGFG2O95081 481 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 ABHD2P08910 425 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 RBP1P09455 135 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 PCNAP12004 261 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 CERS1P27544 350 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 LIM2P55344 173 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 HSD17B7P56937 341 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 RCN2Q14257 317 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 LIPJQ5W064 366 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 FCRLBQ6BAA4 426 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 CYP4X1Q8N118 509 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 LGI4Q8N135 537 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 OR7G3Q8NG95 312 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 PRR7Q8TB68 274 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 DCAKDQ8WVC6 231 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 NPAS2Q99743 824 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 NFU1Q9UMS0 254 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 E2F3O00716 465 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 CDK2AP1O14519 115 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 UGDHO60701 494 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 PRAMEF2O60811 474 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 COL6A2P12110 1019 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 EDN3P14138 238 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 PIK3CGP48736 1102 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 UBE3DQ7Z6J8 389 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 FAM47BQ8NA70 645 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM52Q8NDY8 209 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 CMTM7Q96FZ5 175 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 LYRM4Q9HD34 91 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF358Q9NW07 568 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TMCO1Q9UM00 188 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 RELNP78509 3460 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 BLACEA4D250 179 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 LRRC14BA6NHZ5 514 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 A8MUA0 341 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TRIM49D1C9J1S8 452 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 CYR61O00622 381 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 SEMA7AO75326 666 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 SCELO95171 688 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TGFB1P01137 390 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 PIK3CBP42338 1070 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 SLC13A2Q13183 592 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TUBA3CQ13748 450 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 GTF2H2Q13888 395 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TERF2Q15554 542 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF793Q6ZN11 406 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 CHSY3Q70JA7 882 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HOXD8-204ENST00000544999 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms