RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541284.5

CNOT4-212, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CNOT4, Length 3,563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-212ENST00000541284 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 FAM227AF5H4B4 570 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 GPR37L1O60883 481 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 B4GALT2O60909 372 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 C1orf105O95561 183 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 DNTTP04053 509 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 CKMP06732 381 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 GSTT2P0CG29 244 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 GSTT2BP0CG30 244 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 UGT2B15P54855 530 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 LIM2P55344 173 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 SCARB2Q14108 478 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 IER5LQ5T953 404 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 METTL4Q8N3J2 472 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 SPPL2AQ8TCT8 520 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 MYDGFQ969H8 173 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 FUZQ9BT04 418 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 NDOR1Q9UHB4 597 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 KLK4Q9Y5K2 254 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 A0A1W2PRU2 124 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 A8MU76 341 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 TGM5O43548 720 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 ARAFP10398 606 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 ANXA8P13928 327 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 PIK3CBP42338 1070 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 SPIBQ01892 262 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 ARMCX4Q5H9R4 360 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 TMEM53Q6P2H8 277 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 TP53INP1Q96A56 240 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 FAM129BQ96TA1 746 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 WFDC6Q9BQY6 131 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 BARHL1Q9BZE3 327 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 MTG2Q9H4K7 406 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 EHD1Q9H4M9 534 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 ARRDC5A6NEK1 342 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 ZBBXA8MT70 800 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 HAT1O14929 419 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 LEFTY1O75610 366 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 GASTP01350 101 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 WEE1P30291 646 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 CRATP43155 626 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 TBPL1P62380 186 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 RBBP4Q09028 425 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 TRIM60Q495X7 471 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 P3H2Q8IVL5 708 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 GPR32P1Q8NGA4 272 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 HTRA1Q92743 480 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 OPALINQ96PE5 141 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 CTRCQ99895 268 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 MYNNQ9NPC7 610 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 GRM6O15303 877 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 GPX5O75715 221 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 IRS1P35568 1242 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 TPTEP56180 551 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 DUSP7Q16829 419 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 FBXO43Q4G163 708 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 DESI1Q6ICB0 168 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 RNF130Q86XS8 419 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 OR5AK3PQ8NH89 298 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 FGF11Q92914 225 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 PIP5K1AQ99755 562 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 TCF25Q9BQ70 676 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 HHATLQ9HCP6 504 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 TAAR2Q9P1P5 351 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 C5orf67F2Z3F1 127 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 ARHGAP33O14559 1287 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 PTTG1O95997 202 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 MMP12P39900 470 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-212ENST00000541284 GJA8P48165 433 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms