RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536265.5

DDX11-208, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 5

Gene DDX11, Length 3,603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-208	ENST00000536265	DDC	P20711	480 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	FPR1	P21462	350 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	SHMT2	P34897	504 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	CSNK1G2	P78368	415 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	REEP5	Q00765	189 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	CTBS	Q01459	385 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	PCDH1	Q08174	1060 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	FADD	Q13158	208 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	COX20	Q5RI15	118 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	PROX1	Q92786	737 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	PDXP	Q96GD0	296 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	APOL4	Q9BPW4	351 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	DOHH	Q9BU89	302 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	EXD2	Q9NVH0	621 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	SCN3B	Q9NY72	215 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	SNX7	Q9UNH6	387 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	TNFRSF11B	O00300	401 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	SLC28A2	O43868	658 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ASGR2	P07307	311 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	NR2F1	P10589	423 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	UQCRC2	P22695	453 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	TUBA4A	P68366	448 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	RGS1	Q08116	209 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	BROX	Q5VW32	411 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	CBLL1	Q75N03	491 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	P3H2	Q8IVL5	708 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	NATD1	Q8N6N6	113 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	OR8K5	Q8NH50	307 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	RAB8B	Q92930	207 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	COL26A1	Q96A83	441 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		10.99	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	AHCYL1	O43865	530 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ADAM23	O75077	832 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	IL7R	P16871	459 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	TNFRSF1B	P20333	461 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	RRM2	P31350	389 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	PCGF2	P35227	344 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	CDH12	P55289	794 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ABAT	P80404	500 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	VLDLR	P98155	873 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	RBBP4	Q09028	425 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	PTOV1	Q86YD1	416 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	PSME2	Q9UL46	239 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ADAMDEC1	O15204	470 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	CLEC3A	O75596	197 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	FUCA1	P04066	466 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	BCHE	P06276	602 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	SLAMF1	Q13291	335 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ENPP2	Q13822	863 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	NFATC4	Q14934	902 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	TDH	Q8IZJ6	230 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	FAM3C	Q92520	227 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	GABRG3	Q99928	467 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	S1PR5	Q9H228	398 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	MYO10	Q9HD67	2058 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	UGT2B11	O75310	529 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	SEMA4F	O95754	770 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	ALPPL2	P10696	532 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	NDUFV2	P19404	249 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	TEAD1	P28347	426 aa		10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
DDX11-208	ENST00000536265	MEP1A	Q16819	746 aa		10.98	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms