RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	MPC1L	P0DKB6	136 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	FDFT1	P37268	417 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PIGA	P37287	484 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	NAE1	Q13564	534 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	RUNX2	Q13950	521 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	HSPB2	Q16082	182 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	WLS	Q5T9L3	541 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	C17orf64	Q86WR6	236 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ASB15	Q8WXK1	588 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SARAF	Q96BY9	339 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	VMP1	Q96GC9	406 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	OR4K3	Q96R72	315 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SARG	Q9BW04	601 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	KIFC1	Q9BW19	673 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SGPP1	Q9BX95	441 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PROK2	Q9HC23	129 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SYBU	Q9NX95	663 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PDE10A	Q9Y233	779 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557		E7EVH7	732 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557		H3BMM5	538 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ZBTB14	O43829	449 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ZFAND5	O76080	213 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	MGAT1	P26572	445 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PEX19	P40855	299 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	HK2	P52789	917 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TPM4	P67936	248 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PWP1	Q13610	501 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM14	Q14142	442 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	NT5C	Q8TCD5	201 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CD200R1	Q8TD46	325 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF592	Q92610	1267 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PYCR2	Q96C36	320 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	GBP4	Q96PP9	640 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	LDAH	Q9H6V9	325 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557		E5RI56	91 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SIAH2	O43255	324 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	LIAS	O43766	372 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	HCN1	O60741	890 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CRLF1	O75462	422 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	EPPIN	O95925	133 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	GABRA1	P14867	456 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SCTR	P47872	440 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TRPC1	P48995	793 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TERF2	Q15554	542 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PHKG1	Q16816	387 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	LCTL	Q6UWM7	567 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	RTL4	Q6ZR62	310 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	GK5	Q6ZS86	529 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TCF12	Q99081	682 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	GPR21	Q99679	349 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	JKAMP	Q9P055	326 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	DHRS7	Q9Y394	339 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0G2JN53	185 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TRBC2	A0A5B9	178 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	DVL2	O14641	736 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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