RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520578.5

G3BP1-209, Transcript of G3BP stress granule assembly factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene G3BP1, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1-209ENST00000520578 DLL1O00548 723 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 SCN2BO60939 215 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 DNAJB6O75190 326 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 KIAA0754O94854 1291 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 CPOXP36551 454 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ARL4DP49703 201 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 WNT3P56703 355 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 KCNK10P57789 538 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 SLAMF1Q13291 335 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ILKQ13418 452 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 RUNX2Q13950 521 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ZNF385BQ569K4 471 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 COQ5Q5HYK3 327 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ASRGL1Q7L266 308 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 GLRX5Q86SX6 157 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 RCBTB1Q8NDN9 531 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 VPS33AQ96AX1 596 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 COQ8BQ96D53 544 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 SERINC2Q96SA4 455 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ZBTB18Q99592 522 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 NPAS2Q99743 824 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 TAS2R1Q9NYW7 299 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 MAP10Q9P2G4 905 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 SEC16AO15027 2179 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 A0A1W2PR48 441 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 HYKKA2RU49 373 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 B2RBV5 119 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 CFLARO15519 480 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 MAP3K7O43318 606 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 IL6P05231 212 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 PGRP06401 933 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 IL1RNP18510 177 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 LIMK1P53667 647 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 C2orf80Q0P641 193 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 STX5Q13190 355 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 FAM53BQ14153 422 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 SLC9A5Q14940 896 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 C16orf72Q14CZ0 275 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 MPEG1Q2M385 716 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 DPY19L1Q2PZI1 675 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 SHISA5Q8N114 240 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 STARD8Q92502 1023 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 UCN3Q969E3 161 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 MTERF3Q96E29 417 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 FGF21Q9NSA1 209 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 SCN2AQ99250 2005 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 CCDC154A6NI56 674 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 FXYD1O00168 92 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 MRASO14807 208 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 AIM2O14862 343 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 PROM1O43490 865 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 RFPL3O75679 317 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 OR2B3O76000 313 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 AIFM1O95831 613 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 LAMP1P11279 417 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 ITGAXP20702 1163 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 DDCP20711 480 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 PTPN4P29074 926 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 CCKBRP32239 447 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 HPCAL1P37235 193 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 MNAT1P51948 309 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 ITGA1P56199 1179 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 ACY1Q03154 408 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 GRM7Q14831 915 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-209ENST00000520578 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms