RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 CLDN4O14493 209 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TFECO14948 347 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TAPBPO15533 448 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 B3GALT2O43825 422 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PEX1O43933 1283 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CLEC3AO75596 197 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 KIR3DL1P43629 444 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 GPR143P51810 404 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PLA2G16P53816 162 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 SLC12A2P55011 1212 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 HSD17B7P56937 341 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 RAB38P57729 211 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 GPR85P60893 370 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 SLC13A2Q13183 592 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 MDGA2Q7Z553 956 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 NCLNQ969V3 563 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 ESAMQ96AP7 390 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 QRFPRQ96P65 431 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 DMRTA2Q96SC8 542 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CAPS2Q9BXY5 557 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 DERL2Q9GZP9 239 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 NT5DC2Q9H857 520 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 POPDC3Q9HBV1 291 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PKDREJQ9NTG1 2253 aa15.77■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 GTF3C1Q12789 2109 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GTH9 108 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ANKDD1BA6NHY2 528 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 HS6ST1O60243 411 aa15.76■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 GSTM2P28161 218 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 PTGS2P35354 604 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 RPL21P46778 160 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 GNG11P61952 73 aa15.76■□□□□ 0.11
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HERC3-211ENST00000513325 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 VN1R5Q7Z5H4 357 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 FAM47BQ8NA70 645 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 OR2L5Q8NG80 312 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 SDCCAG3Q96C92 435 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 WWOXQ9NZC7 414 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 GPRC5BQ9NZH0 403 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 PPT2Q9UMR5 302 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 SNX24Q9Y343 169 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 A0A088AWK7 358 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CCDC188H7C350 402 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 PRAMEF4O60810 478 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ZFAND5O76080 213 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 TPOP07202 933 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 TFEBP19484 476 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CERS1P27544 350 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 SSR4P51571 173 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 LIM2P55344 173 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 POU4F1Q01851 419 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ADPRMQ3LIE5 342 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CMPK2Q5EBM0 449 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 TRIM40Q6P9F5 258 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 GPSM1Q86YR5 675 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 EID3Q8N140 333 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 TCAIMQ8N3R3 496 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 C16orf52Q8NHV5 167 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 FAM57AQ8TBR7 257 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 SERINC2Q96SA4 455 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CSF3RQ99062 836 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 CCDC77Q9BR77 488 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 KCMF1Q9P0J7 381 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 DAPP1Q9UN19 280 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 SAR1BQ9Y6B6 198 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 PDZD2O15018 2839 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-211ENST00000513325 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa15.74■□□□□ 0.11
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