RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-208ENST00000512656 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 ATL1Q8WXF7 558 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 TM4SF19Q96DZ7 209 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 MAGED4Q96JG8 741 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 OR1F2PQ96R84 312 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 NAT9Q9BTE0 207 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 MMP25Q9NPA2 562 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 PDE10AQ9Y233 779 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 MED16Q9Y2X0 877 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.76□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 URADA6NGE7 173 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 SLC19A2O60779 497 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 RDH16O75452 317 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 STATHP02808 62 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 CDH1P12830 882 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 COX6B1P14854 86 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 AGAP20933 346 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 JAK1P23458 1154 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 MST1P26927 711 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 HTR1EP28566 365 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 FNTAP49354 379 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 AP1S2P56377 157 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 OR4D2P58180 307 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 IL2P60568 153 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 MPP1Q00013 466 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 RGS1Q08116 209 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 PWP1Q13610 501 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 TUBA3CQ13748 450 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 CRYMQ14894 314 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 PPP1R7Q15435 360 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 OR1C1Q15619 314 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 MLANAQ16655 118 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 CYP1B1Q16678 543 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 SFT2D3Q587I9 215 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 DUPD1Q68J44 220 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 TTC27Q6P3X3 843 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 ABHD13Q7L211 337 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 LGI4Q8N135 537 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 EID3Q8N140 333 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 BEST3Q8N1M1 668 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 LINGO1Q96FE5 620 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 SARGQ9BW04 601 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 SGPP1Q9BX95 441 aa6.75□□□□□ -1.33
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USP46-208ENST00000512656 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 ARL15Q9NXU5 204 aa6.75□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.75□□□□□ -1.33
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USP46-208ENST00000512656 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.74□□□□□ -1.33
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USP46-208ENST00000512656 TRBC2A0A5B9 178 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 FEZF1A0PJY2 475 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 FAM227AF5H4B4 570 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 NDC80O14777 642 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 NDUFS4O43181 175 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 OR1F1O43749 312 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 TSPAN15O95858 294 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 CBX7O95931 251 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 SERPIND1P05546 499 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 PGRP06401 933 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 FHP07954 510 aa6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
USP46-208ENST00000512656 NPPBP16860 134 aa6.74□□□□□ -1.33
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