RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	MYBPC3	Q14896	1274 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	RASA2	Q15283	850 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	EMB	Q6PCB8	327 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSLP	Q969D9	159 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CAVIN3	Q969G5	261 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	UBE2E3	Q969T4	207 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAR2	Q96K12	515 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR1F2P	Q96R84	312 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR51B5	Q9H339	312 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	VPS4A	Q9UN37	437 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	POLQ	O75417	2590 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	UGDH	O60701	494 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	GSTA1	P08263	222 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	NUDT17	P0C025	328 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	IL10	P22301	178 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CERS1	P27544	350 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDH13	P55290	713 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	RIPPLY3	P57055	190 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRAF3	Q13114	568 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	UNC50	Q53HI1	259 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	LCA5	Q86VQ0	697 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	VPS50	Q96JG6	964 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	NTMT1	Q9BV86	223 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPCS	Q9HAB8	311 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		14.9	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325		H0YIV9	168 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDH16	O75309	829 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLDN9	O95484	217 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAC1	P20366	129 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	NEK2	P51955	445 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCNG1	P51959	295 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	NADK2	Q4G0N4	442 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM237	Q96Q45	408 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PHF12	Q96QT6	1004 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SERINC2	Q96SA4	455 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAB21	Q9UL25	225 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		14.89	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TTLL8	A6PVC2	850 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDH17	O14917	1159 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	B3GALT2	O43825	422 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	GLRA3	O75311	464 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CYC1	P08574	325 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PIK3CB	P42338	1070 aa		14.88	□□□□□ -0.03

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