RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491592.1

RTN4-215, Transcript of reticulon 4, human

TSL 2

Gene RTN4, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTN4-215	ENST00000491592	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	USH1G	Q495M9	461 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	STX12	Q86Y82	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CENPK	Q9BS16	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	MECR	Q9BV79	373 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	LAMB1	P07942	1786 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592		A8MUI8	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	MEI4	A8MW99	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592		A8MXQ7	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	LIAS	O43766	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC22	O60826	627 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CDH16	O75309	829 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CLN5	O75503	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	TTC4	O95801	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	GAS8	O95995	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	LDLR	P01130	860 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SBK2	P0C263	348 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC166	P0CW27	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	ACP5	P13686	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	TNNI3	P19429	210 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	FUT1	P19526	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	TAC1	P20366	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	KLRC2	P26717	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	RANBP1	P43487	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	NHLH1	Q02575	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	TFF2	Q03403	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	RBPJ	Q06330	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CALCRL	Q16602	461 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CDO1	Q16878	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RTN4-215	ENST00000491592	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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