RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ADNP2Q6IQ32 1131 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A25Q6KCM7 469 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CMC1Q7Z7K0 106 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FBF1Q8TES7 1133 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NCLNQ969V3 563 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MARVELD3Q96A59 401 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 F2RL3Q96RI0 385 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RBBP8Q99708 897 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NPAS2Q99743 824 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RNF32Q9H0A6 362 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RAB17Q9H0T7 212 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 LRIT2A6NDA9 550 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 WIPF3A6NGB9 483 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SAGE2PA6NJ88 616 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 G3V3Y1 287 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 UBXN8O00124 270 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 WWP2O00308 870 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TFECO14948 347 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FANCGO15287 622 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TP73O15350 636 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TGFB1P01137 390 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 STSP08842 583 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GFAPP14136 432 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CD1DP15813 335 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF24P17028 368 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TFEBP19484 476 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 STX2P32856 288 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CLCN2P51788 898 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TDGF1P3P51864 188 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RAP1GDS1P52306 607 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MTTPP55157 894 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 RAB38P57729 211 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6V0D1P61421 351 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CDKL1Q00532 357 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PLGLB1Q02325 96 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 C3AR1Q16581 482 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PAGE2BQ5JRK9 111 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 GRTP1Q5TC63 336 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MROH9Q5TGP6 573 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 C8orf74Q6P047 294 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MDS2Q8NDY4 140 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TTLQ8NG68 377 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 DOK4Q8TEW6 326 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD7Q92527 254 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC120Q96HB5 630 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 OPTCQ9UBM4 332 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SPACA6W5XKT8 324 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 POLQO75417 2590 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 LRBAP50851 2863 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 F8P00451 2351 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 FAM159BA6NKW6 160 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ASNA1O43681 348 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 LDB3O75112 727 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 ITGA10O75578 1167 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CLEC3AO75596 197 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 CPN2P22792 545 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HTR1EP28566 365 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SSR2P43308 183 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 SLC6A12P48065 614 aa7.54□□□□□ -1.2
CTPS1-209ENST00000480420 KCNC1P48547 511 aa7.54□□□□□ -1.2
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