RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 ERICH4A6NGS2 130 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC154A6NI56 674 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 B4DGG1 531 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TBX19O60806 448 aa6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 KRT34O76011 436 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SOX30O94993 753 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 RETREG3Q86VR2 466 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 OR2L5Q8NG80 312 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TM4SF19Q96DZ7 209 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 APOLD1Q96LR9 279 aa6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 ACPTQ9BZG2 426 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.69□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.68□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 TLCD2A6NGC4 264 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 H0YHG0 523 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 GSC2O15499 205 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PRAMEF4O60810 478 aa6.68□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 C9P02748 559 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 CD22P20273 847 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 IL10P22301 178 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ALDH4A1P30038 563 aa6.68□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
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