RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 IER5Q5VY09 327 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ATCAYQ86WG3 371 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM131BQ86XD5 332 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF130Q86XS8 419 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 KLBQ86Z14 1044 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 EFHBQ8N7U6 833 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF383Q8NA42 475 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 STK35Q8TDR2 534 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 HGDQ93099 445 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF31Q96EP0 1072 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF599Q96NL3 588 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 GUCD1Q96NT3 240 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 WDFY2Q96P53 400 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 MMP19Q99542 508 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 DUSP21Q9H596 190 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 SIX2Q9NPC8 291 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A087X0M5 115 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A0B4J293 547 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1B0GX30 115 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PP18 115 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2A25A4D2G3 310 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2AT4A6NND4 320 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 B4E171 279 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 LGALS8O00214 317 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 TSPAN6O43657 245 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 NPHS1O60500 1241 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 MPC2O95563 127 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 CYBBP04839 570 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ITGAVP06756 1048 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 HEXAP06865 529 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 IFNGR1P15260 489 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 GNA15P30679 374 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 SERPINF1P36955 418 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 HTR5AP47898 357 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 NRIP1P48552 1158 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 LHX1P48742 406 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 EPHA4P54764 986 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 FCGRTP55899 365 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 TNFRSF17Q02223 184 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 TAP2Q03519 686 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 CD47Q08722 323 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 P2RY14Q15391 338 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 IQCHQ86VS3 1027 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 SYT14Q8NB59 555 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 TNFRSF14Q92956 283 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM143Q96AN5 459 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 GGACTQ9BVM4 153 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 COA1Q9GZY4 146 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-208ENST00000471759 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms