RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TUBA4AP68366 448 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ10P78508 379 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 VLDLRP98155 873 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 RELAQ04206 551 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 VAC14Q08AM6 782 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 RBBP4Q09028 425 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FADDQ13158 208 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SGCGQ13326 291 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FZD5Q13467 585 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MLC1Q15049 377 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CEBPEQ15744 281 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ALG11Q2TAA5 492 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO43Q4G163 708 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM35AQ53FP2 167 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 COX20Q5RI15 118 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SAXO2Q658L1 398 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FAHD1Q6P587 224 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 VN1R4Q7Z5H5 301 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FAM124AQ86V42 546 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB123Q8N688 67 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 AMER3Q8N944 861 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OR2L3Q8NG85 312 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OR4C15Q8NGM1 316 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OR5K1Q8NHB7 308 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO30Q8TB52 745 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TM4SF19Q96DZ7 209 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NEURL3Q96EH8 262 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SIPA1Q96FS4 1042 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM10Q96HG1 83 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FBXL20Q96IG2 436 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CNBD2Q96M20 576 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PRAP1Q96NZ9 151 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 QRFPRQ96P65 431 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PHOX2BQ99453 314 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ABCG4Q9H172 646 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SERHL2Q9H4I8 314 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 XKR8Q9H6D3 395 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM184CQ9NVA4 438 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R9Q9NYW1 312 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 EHD3Q9NZN3 535 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 LIMD1Q9UGP4 676 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CES1P1Q9UKY3 287 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 VPS4AQ9UN37 437 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ABCG2Q9UNQ0 655 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PADI2Q9Y2J8 665 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ASB4Q9Y574 426 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DGKBQ9Y6T7 804 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC88CQ9P219 2028 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OR2A25A4D2G3 310 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 H0Y8X5 98 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 RTCAO00442 366 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 HAT1O14929 419 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GSTA4O15217 222 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GPR37O15354 613 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SLC16A6O15403 523 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SLC31A1O15431 190 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NARSO43776 548 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NOBOXO60393 691 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SH3BGRLO75368 114 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OR6B1O95007 311 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CST1P01037 141 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GBAP04062 536 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 THRBP10828 461 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ITGAMP11215 1152 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ETFAP13804 333 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CD247P20963 164 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CD72P21854 359 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
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