RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446233.1

UBQLN4P2-201, Transcript of ubiquilin 4 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene UBQLN4P2, Length 948 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.51□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 NT5CQ8TCD5 201 aa9.51□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SMPDL3BQ92485 455 aa9.51□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZNF592Q92610 1267 aa9.51□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 NCLNQ969V3 563 aa9.51□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.51□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 RASL10BQ96S79 203 aa9.51□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CCDC77Q9BR77 488 aa9.51□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SGPP1Q9BX95 441 aa9.51□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.51□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 MMACHCQ9Y4U1 282 aa9.51□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.51□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TRBC2A0A5B9 178 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 G3V3Y1 287 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CRLF1O75462 422 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ATP6AP2O75787 350 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 C8BP07358 591 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CDH1P12830 882 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 NPPBP16860 134 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TIMP3P35625 211 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 OASLQ15646 514 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 LCTLQ6UWM7 567 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CENPUQ71F23 418 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CILP2Q8IUL8 1156 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CNGA4Q8IV77 575 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 P3H2Q8IVL5 708 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 VSTM4Q8IW00 320 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 LRRC57Q8N9N7 239 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 KCNJ9Q92806 393 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SCYL1Q96KG9 808 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SGCZQ96LD1 299 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 Q96MF0 132 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 KIFC1Q9BW19 673 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 LDAHQ9H6V9 325 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 JKAMPQ9P055 326 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZFP69BQ9UJL9 534 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.5□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 GOLGA8TH3BQL2 631 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 AP3B1O00203 1094 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 OR1F1O43749 312 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 AVILO75366 819 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 EPPINO95925 133 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 NPY2RP49146 381 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 DNASE1L1P49184 302 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CCR8P51685 355 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZNF136P52737 540 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 HK2P52789 917 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 HSD17B7P56937 341 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 RGS1Q08116 209 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CUL1Q13616 776 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 HECTD2Q5U5R9 776 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 LACC1Q8IV20 430 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 LINC01560Q8TB33 94 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 PIGTQ969N2 578 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 MFSD3Q96ES6 412 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SMIM10Q96HG1 83 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 DACH2Q96NX9 599 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 HAUS8Q9BT25 410 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ACKR4Q9NPB9 350 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 DHRS7Q9Y394 339 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.49□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa9.48□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 AHRRA9YTQ3 701 aa9.48□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 WWP2O00308 870 aa9.48□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
UBQLN4P2-201ENST00000446233 CBFA2T2O43439 604 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms