RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PEX11G	Q96HA9	241 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	F2RL3	Q96RI0	385 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	DAPP1	Q9UN19	280 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PCSK5	Q92824	1860 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN4	O14493	209 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TM9SF1	O15321	606 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TYROBP	O43914	113 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM13	O60858	407 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TGFB1	P01137	390 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ICAM2	P13598	275 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	RAP1GDS1	P52306	607 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	RHAG	Q02094	409 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CFAP157	Q5JU67	520 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	EXD3	Q8N9H8	876 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SLC39A7	Q92504	469 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CDK15	Q96Q40	435 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	AHSP	Q9NZD4	102 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF225	Q9UK10	706 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SPACA6	W5XKT8	324 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SERTM1	A2A2V5	107 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PLPP1	O14494	284 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	FFAR3	O14843	346 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	GPR42	O15529	346 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	FAM87A	P0C7U9	286 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	COX6A1	P12074	109 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINB5	P36952	375 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SSR2	P43308	183 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	NAGLU	P54802	743 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	LIM2	P55344	173 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	HSD17B7	P56937	341 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PCLAF	Q15004	111 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	AGAP11	Q8TF27	550 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CNDP1	Q96KN2	507 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	OR51B5	Q9H339	312 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PHF11	Q9UIL8	331 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	PPP6C	O00743	305 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	NPHS1	O60500	1241 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	PRMT3	O60678	531 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	ULK1	O75385	1050 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	JRK	O75564	520 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	OR4F21	O95013	312 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	B3GALT4	O96024	378 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	CERS1	P27544	350 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	FOXL2	P58012	376 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	BIK	Q13323	160 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	RUNX2	Q13950	521 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	MYBPC3	Q14896	1274 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	NSDHL	Q15738	373 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		13.77	□□□□□ -0.21

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