RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 OR2M7Q8NG81 312 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CD200R1Q8TD46 325 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ACTRT1Q8TDG2 376 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 HAUS8Q9BT25 410 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 FUT8Q9BYC5 575 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PARVBQ9HBI1 364 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ZFATQ9P243 1243 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 Q9UFV3 132 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 VPS13CQ709C8 3753 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ATRQ13535 2644 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 HAX1O00165 279 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 AQP7O14520 342 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 NDUFS4O43181 175 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SUSD5O60279 629 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 WDR1O75083 606 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 C8GP07360 202 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PAMP19021 973 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 MAOAP21397 527 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CNR1P21554 472 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 HOXC12P31275 282 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 AHRP35869 848 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ADH7P40394 386 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 KIR2DL3P43628 341 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SCTRP47872 440 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SSR4P51571 173 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 GPR85P60893 370 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 LTBQ06643 244 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 FOXO1Q12778 655 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 HYAL2Q12891 473 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SP140Q13342 867 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CUL1Q13616 776 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 XKR6Q5GH73 641 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF470Q6ECI4 717 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 TRILQ7L0X0 811 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ABHD13Q7L211 337 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CDC20BQ86Y33 519 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CYP4X1Q8N118 509 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 OR56A3Q8NH54 315 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 FAM222BQ8WU58 562 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ARSGQ96EG1 525 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 VMP1Q96GC9 406 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SNF8Q96H20 258 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SMC6Q96SB8 1091 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 GPR21Q99679 349 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ATG10Q9H0Y0 220 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 A6NNC1 897 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 A8MUA0 341 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 A8MVJ9 347 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ACOT7O00154 380 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 OR1F1O43749 312 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ZFAND5O76080 213 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ATE1O95260 518 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 B3GALT4O96024 378 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 OLR1P78380 273 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 RGS1Q08116 209 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 CTBP1Q13363 440 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 SNX1Q13596 522 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC00578-201ENST00000439009 DUPD1Q68J44 220 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms