RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 NRTNQ99748 197 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC3Q9BQI4 270 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 EBPLQ9BY08 206 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM15Q9C019 465 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 POMPQ9Y244 141 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PRB8 838 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PROM1O43490 865 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 AKAP10O43572 662 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL18O94889 574 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SOX30O94993 753 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 KRT75O95678 551 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 RETP07949 1114 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 IFI6P09912 130 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 UMPSP11172 480 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 CKMT1AP12532 417 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ST6GAL1P15907 406 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 GPX2P18283 190 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 HTR1EP28566 365 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 CD1CP29017 333 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ARL4DP49703 201 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PLA2G16P53816 162 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PHC1P78364 1004 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 BTN3A2P78410 334 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 HKDC1Q2TB90 917 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 OR4F3Q6IEY1 312 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SLC2A7Q6PXP3 512 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PLD3Q8IV08 490 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 OR7A2PQ8NGA2 310 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 OR8K5Q8NH50 307 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJB14Q8TBM8 379 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 MOAP1Q96BY2 351 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 MVB12AQ96EY5 273 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PANX1Q96RD7 426 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 MAP3K3Q99759 626 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 C17orf62Q9BQA9 187 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL31Q9H511 634 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 IL21RQ9HBE5 538 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 GIMAP4Q9NUV9 329 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PDP2Q9P2J9 529 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 VPS4AQ9UN37 437 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 CDC14AQ9UNH5 594 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ASB4Q9Y574 426 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 FITM1A5D6W6 292 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ASPDHA6ND91 283 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 AQP12BA6NM10 295 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 FXYD1O00168 92 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SIGLEC6O43699 453 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SH3BGRLO75368 114 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SLITRK5O94991 958 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 LRATO95237 230 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 BMP10O95393 424 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 CPNE6O95741 557 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 GP1BAP07359 652 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 IL3P08700 152 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 LAMP1P11279 417 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 CD1EP15812 388 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 IL10P22301 178 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PPP2R1BP30154 601 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 MPIP34949 423 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 MPLP40238 635 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 LSSP48449 732 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SLC7A2P52569 658 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ARSFP54793 590 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.9 ms