RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCND1P24385 295 aa15.29■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STIP1P31948 543 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR143P51810 404 aa15.29■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POU4F3Q15319 338 aa15.29■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.29■□□□□ 0.04
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF750Q32MQ0 723 aa15.29■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POMZP3Q6PJE2 187 aa15.29■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRELID2Q8N945 189 aa15.29■□□□□ 0.04
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa15.29■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.28■□□□□ 0.04
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM64BA6NI03 449 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR1F1O43749 312 aa15.28■□□□□ 0.04
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFNA2P01563 188 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDH1P12830 882 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNASE1L1P49184 302 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLCN7P51798 805 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AADACL2Q6P093 401 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PODNL1Q6PEZ8 512 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OPN5Q6U736 354 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STRA8Q7Z7C7 330 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NT5CQ8TCD5 201 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM158Q8WZ71 300 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ISL2Q96A47 359 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCYL1Q96KG9 808 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHBGQ9H310 441 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPDZO75970 2070 aa15.28■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PPR1 153 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WWP2O00308 870 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CASKO14936 926 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VAPBO95292 243 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 B3GALT4O96024 378 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERPIND1P05546 499 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OPRM1P35372 400 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCR8P51685 355 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF136P52737 540 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCTLQ6UWM7 567 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSDL2Q6YN16 418 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LIX1Q8N485 282 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEIL3Q8TAT5 605 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAPZA3Q96KX2 299 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HAUS8Q9BT25 410 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL22Q9GZX6 179 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACKR4Q9NPB9 350 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SH2B3Q9UQQ2 575 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATG4BQ9Y4P1 393 aa15.27■□□□□ 0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBC2A0A5B9 178 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AP3B1O00203 1094 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MFAP3LO75121 409 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APRTP07741 180 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OGNP20774 298 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FPR1P21462 350 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NMBRP28336 390 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPATCH11Q8N954 259 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALG3Q92685 438 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB6BQ9NRW1 208 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFP69BQ9UJL9 534 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SH3D21A4FU49 640 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLDN4O14493 209 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTSSP25774 331 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARNTP27540 789 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPY2RP49146 381 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HK2P52789 917 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSD17B7P56937 341 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CUL1Q13616 776 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BMPR2Q13873 1038 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYHR1Q6ZMK1 362 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PM20D2Q8IYS1 436 aa15.25■□□□□ 0.03
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