RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLHL41O60662 606 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 B4GALT2O60909 372 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SH3BGRLO75368 114 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COX6A1P12074 109 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPA3P15088 417 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITGA3P26006 1051 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SSR2P43308 183 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSFMP43897 325 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PGDP52209 483 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EFNA3P52797 238 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAA20P61599 178 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RHAGQ02094 409 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LCP2Q13094 533 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABRAXAS2Q15018 415 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AP5B1Q2VPB7 878 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LETMD1Q6P1Q0 360 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NDUFAF7Q7L592 441 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBE3DQ7Z6J8 389 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CROCCP2Q86T23 111 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF175Q8N4F7 328 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCNYL1Q8N7R7 359 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BANPQ8N9N5 519 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF382Q96SR6 550 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MESP1Q9BRJ9 268 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF160Q9HCG1 818 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRDM7Q9NQW5 492 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSD3Q9NYI0 1048 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SENP1Q9P0U3 644 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRPS1Q9UHF7 1281 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNX6Q9UNH7 406 aa16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYO18BQ8IUG5 2567 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2W5A6NFC9 320 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MASP2O00187 686 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTCAO00442 366 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP6CO00743 305 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRMT3O60678 531 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALPPP05187 535 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEK2P51955 445 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARFIP1P53367 373 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOX8P57073 446 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB38P57729 211 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNAJB13P59910 316 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NFATC3Q12968 1075 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CUL3Q13618 768 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAPSNQ13702 412 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RUNX2Q13950 521 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYBPC3Q14896 1274 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NSDHLQ15738 373 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP157Q5JU67 520 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEP85LQ5SZL2 805 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 QSOX2Q6ZRP7 698 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IQCKQ8N0W5 287 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLPP5Q8NEB5 264 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYRIPQ8NFW9 859 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGMAQ96B86 450 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZIM3Q96PE6 472 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SERPINI1Q99574 410 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF700Q9H0M5 742 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPT2Q9UMR5 302 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLLPQ9Y342 182 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPACA6W5XKT8 324 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCSK5Q92824 1860 aa16.35■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A1B0GTL3 188 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLPP1O14494 284 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR4F21O95013 312 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCELO95171 688 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAGLUP54802 743 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LIM2P55344 173 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PKNOX1P55347 436 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AP2B1P63010 937 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LIPMQ5VYY2 423 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR4C11Q6IEV9 310 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF793Q6ZN11 406 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LANCL3Q6ZV70 420 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASB18Q6ZVZ8 466 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD37Q7Z713 158 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDYL2Q8N8U2 506 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACOT4Q8N9L9 421 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM47BQ8NA70 645 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARMC2Q8NEN0 867 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSLPQ969D9 159 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTCHD1Q96NR3 888 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TUBB6Q9BUF5 446 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUDT9Q9BW91 350 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.34■□□□□ 0.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CENPHQ9H3R5 247 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms