RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 PPM1NQ8N819 430 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 QRFPRQ96P65 431 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 NT5DC2Q9H857 520 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 FCHO1O14526 889 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 NME2P1O60361 137 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SH3BGRLO75368 114 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 STK16O75716 305 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 MLYCDO95822 493 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 C1QAP02745 245 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 PRF1P14222 555 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 NME2P22392 152 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CASQ1P31415 396 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 RFC3P40938 356 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CLCN2P51788 898 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 RAB10P61026 200 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ATP6V0D1P61421 351 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 DOC2AQ14183 400 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 TRADDQ15628 312 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 RAPH1Q70E73 1250 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 APCDD1LQ8NCL9 501 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 PDPRQ8NCN5 879 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 OR2L5Q8NG80 312 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 NCLNQ969V3 563 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ALG9Q9H6U8 611 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CACNA1CQ13936 2221 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 A0A088AWK7 358 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SUPT3HO75486 399 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ZNF24P17028 368 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 EPORP19235 508 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 GSTM2P28161 218 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 GGT5P36269 586 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 MSH2P43246 934 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 MEOX1P50221 254 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 HLCSP50747 726 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 LIM2P55344 173 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 DLG1Q12959 904 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CHIT1Q13231 466 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SIAH3Q8IW03 269 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SLC34A3Q8N130 599 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 FBF1Q8TES7 1133 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 KIAA1191Q96A73 305 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 VMP1Q96GC9 406 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 F2RL3Q96RI0 385 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SERINC2Q96SA4 455 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 EHD1Q9H4M9 534 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 UBXN8O00124 270 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CLDN4O14493 209 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ASNA1O43681 348 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ITGA10O75578 1167 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 IFNA16P05015 189 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 GSTA2P09210 222 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SLC35E2BP0CK96 405 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 PCNAP12004 261 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 ABOP16442 354 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 TFEBP19484 476 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 MAGEA4P43358 317 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 KCNC1P48547 511 aa14.49□□□□□ -0.09
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